użycie awk do zaznaczenia linii w pliku A, na podstawie znalezienia dopasowań w pliku B

Question

May 14, 2012, 03:43 PM

użycie awk do zaznaczenia linii w pliku A, na podstawie znalezienia dopasowań w pliku B

Mam dwa pliki, plik A wygląda tak:

1       101427      GENE|ACT-A      1       101589      GENE|ACT-B    0.0357
1       101427      GENE|ACT-A      1       101785      GENE|ACT-C    0.6357
1       101427      GENE|TAD-J      1       101437      GENE|TAD-L    0.8967
1       101427      GENE|TAD-J      1       158988      GENE|TAD-O    0.0067
1       101427      GENE|TAD-J      1       159999      GENE|TAD-V    0.5427
1       101427      GENE|POL-D      1       101437      GENE|POL-H    0.2347

a plik B wygląda tak:

GENE|ACT-A
GENE|TAD-L
GENE|POL-D

Chciałbym wybrać linie w pliku A, gdzie kolumna 3 lub kolumna 6 mają dopasowanie w pliku B. W powyższym przykładzie wynik będzie wyglądał następująco:

1       101427      GENE|ACT-A      1       101589      GENE|ACT-B    0.0357
1       101427      GENE|ACT-A      1       101785      GENE|ACT-C    0.6357
1       101427      GENE|TAD-J      1       101437      GENE|TAD-L    0.8967
1       101427      GENE|POL-D      1       101437      GENE|POL-H    0.2347

Czy można to osiągnąć po prostu przy pomocy awk.

Twoje zdrowie.