Pętlowanie przez wszystkie pliki w katalogu w R, stosowanie wielu poleceń [duplikat]
To pytanie ma już odpowiedź tutaj:
Która metoda jest najlepsza do powtarzalnego stosowania skryptu w plikach n .csv w R? 2 odpowiedzi Muszę zastosować zestaw poleceń w R do wszystkich indywidualnych.txt pliki (około 300) w katalogu.
Nie znam się zbyt dobrze na R, więc cała pomoc, na którą patrzyłem w Internecie na temat zapętlania, jest myląca lub nie mogę wymyślić, jak zastosować pętlę, gdy trzeba zastosować wiele poleceń do każdego plik
Polecenia, które muszę zastosować do każdego pliku (drzew filogenetycznych) w katalogu to (który korzysta z biblioteki ape R):
testtree <- read.tree("tree123.txt")
unrooted_tr <- unroot(testtree)
write.tree(unrooted_tr, file="unrootedtree123.txt")
Jak zastosować pętlę, która zastosuje te polecenia do każdego pliku .txt (przy użyciu R lub wiersza poleceń systemu Unix)? Dane wyjściowe (np. Unrootedtree123.txt) będą musiały mieć inną nazwę dla każdego pliku.
Z góry dziękuję, Dani.