Dlaczego mnożenie macierzy jest szybsze z numpy niż z ctypami w Pythonie?

Próbowałem wymyślić najszybszy sposób na mnożenie macierzy i wypróbowałem 3 różne sposoby:

Czysta implementacja Pythona: żadnych niespodzianek.Numpy implementacja przy użyciunumpy.dot(a, b)Współpraca z C przy użyciuctypes moduł w Pythonie.

To jest kod C, który jest przekształcany w bibliotekę współdzieloną:

<code>#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

void matmult(float* a, float* b, float* c, int n) {
    int i = 0;
    int j = 0;
    int k = 0;

    /*float* c = malloc(nay * sizeof(float));*/

    for (i = 0; i < n; i++) {
        for (j = 0; j < n; j++) {
            int sub = 0;
            for (k = 0; k < n; k++) {
                sub = sub + a[i * n + k] * b[k * n + j];
            }
            c[i * n + j] = sub;
        }
    }
    return ;
}
</code>

I kod Pythona, który go wywołuje:

<code>def C_mat_mult(a, b):
    libmatmult = ctypes.CDLL("./matmult.so")

    dima = len(a) * len(a)
    dimb = len(b) * len(b)

    array_a = ctypes.c_float * dima
    array_b = ctypes.c_float * dimb
    array_c = ctypes.c_float * dima

    suma = array_a()
    sumb = array_b()
    sumc = array_c()

    inda = 0
    for i in range(0, len(a)):
        for j in range(0, len(a[i])):
            suma[inda] = a[i][j]
            inda = inda + 1
        indb = 0
    for i in range(0, len(b)):
        for j in range(0, len(b[i])):
            sumb[indb] = b[i][j]
            indb = indb + 1

    libmatmult.matmult(ctypes.byref(suma), ctypes.byref(sumb), ctypes.byref(sumc), 2);

    res = numpy.zeros([len(a), len(a)])
    indc = 0
    for i in range(0, len(sumc)):
        res[indc][i % len(a)] = sumc[i]
        if i % len(a) == len(a) - 1:
            indc = indc + 1

    return res
</code>

Założę się, że wersja używająca C byłaby szybsza ... i straciłbym! Poniżej znajduje się mój benchmark, który wydaje się pokazywać, że albo zrobiłem to nieprawidłowo, albo tonumpy jest głupio szybki:

Chciałbym zrozumieć, dlaczegonumpy wersja jest szybsza niżctypes Wersja, nie mówię nawet o czystej implementacji Pythona, ponieważ jest to dość oczywiste.

questionAnswers(6)

yourAnswerToTheQuestion