Результаты поиска по запросу "bioinformatics"
Как построить положение вдоль хромосомной графики
Я хотел бы создать график, изображающий 14 линейных хромосом для организма, над которым я работаю, в масштабе, с цветными полосами в указанных местах вдоль к...
Обработка данных
У меня есть датафрейм, который я прочитал
Чтение в файле блок за блоком, используя указанный разделитель в Python
У меня есть файл input_file.fa, как это (FASTA формат):
наверняка, вы могли бы, вероятно, запустить Python / ваш скрипт от имени администратора, чтобы передать ошибку разрешения, хотя
я есть программа на Фортране, и я хочу выполнить ее на python для нескольких файлов. У меня 2000 входных файлов, но в моем коде на Фортране я могу запускать ...
, Я не уверен почему.
не сгенерировать все возможные перестановки дерева Ньюика для набора видов, данного внешней группе? Для тех, кто не знает, что такое формат дерева Ньюика, хорошее описание доступно по ...
функция.
я есть огромный входной файл (типичный образец которого показан ниже какinput): > input CT1 CT2 CT3 1 chr1:200-400 chr1:250-450 chr1:400-800 2 chr1:800-970 chr2:200-500 chr1:700-870 3 chr2:300-700 chr2:600-1000 chr2:700-1400Я хочу обработать ...
Вот еще один вариант рабочего решения:
ько начал изучать Python, и здесь у меня есть отсортированный список последовательностей белков (всего 59 000 последовательностей), и некоторые из них перекрываются. Я сделал список игрушек здесь, например: ABCDE ABCDEFG ABCDEFGH ABCDEFGHIJKLMNO ...
Оказывается, что прогулки по ДНК не очень полезны на практике, но позволяют интуитивно понятную визуализацию. У меня нет его в руках, но я полагаю, что мой коллега был бы более чем рад предоставить код Matlab, используемый для генерации рисунка ниже.
ужно сгенерировать случайное блуждание на основе последовательности ДНК вируса, учитывая его последовательность пар оснований из 2 тыс. Пар оснований. Последовательность выглядит как «ATGCGTCGTAACGT». Путь должен повернуть направо для A, налево ...