Вот еще один вариант рабочего решения:

ько начал изучать Python, и здесь у меня есть отсортированный список последовательностей белков (всего 59 000 последовательностей), и некоторые из них перекрываются. Я сделал список игрушек здесь, например:

ABCDE
ABCDEFG
ABCDEFGH
ABCDEFGHIJKLMNO
CEST
DBTSFDE
DBTSFDEO
EOEUDNBNUW
EOEUDNBNUWD
EAEUDNBNUW
FEOEUDNBNUW
FG
FGH

Я хотел бы удалить это более короткое перекрытие и просто оставить самое длинное, чтобы желаемый результат выглядел так:

ABCDEFGHIJKLMNO
CEST
DBTSFDEO
EAEUDNBNUW
FEOEUDNBNUWD
FGH

Как я могу это сделать? Мой код выглядит так:

with open('toy.txt' ,'r') as f:
    pattern = f.read().splitlines()
    print pattern

    for i in range(0, len(pattern)):
        if pattern[i] in pattern[i+1]:
            pattern.remove(pattern[i])
        print pattern

И я получил сообщение об ошибке:

['ABCDE', 'ABCDEFG', 'ABCDEFGH', 'ABCDEFGHIJKLMNO', 'CEST', 'DBTSFDE', 'DBTSFDEO', 'EOEUDNBNUW', 'EAEUDNBNUW', 'FG', 'FGH']
['ABCDEFG', 'ABCDEFGH', 'ABCDEFGHIJKLMNO', 'CEST', 'DBTSFDE', 'DBTSFDEO', 'EOEUDNBNUW', 'EAEUDNBNUW', 'FG', 'FGH']
['ABCDEFG', 'ABCDEFGHIJKLMNO', 'CEST', 'DBTSFDE', 'DBTSFDEO', 'EOEUDNBNUW', 'EAEUDNBNUW', 'FG', 'FGH']
['ABCDEFG', 'ABCDEFGHIJKLMNO', 'CEST', 'DBTSFDE', 'DBTSFDEO', 'EOEUDNBNUW', 'EAEUDNBNUW', 'FG', 'FGH']
['ABCDEFG', 'ABCDEFGHIJKLMNO', 'CEST', 'DBTSFDEO', 'EOEUDNBNUW', 'EAEUDNBNUW', 'FG', 'FGH']
['ABCDEFG', 'ABCDEFGHIJKLMNO', 'CEST', 'DBTSFDEO', 'EOEUDNBNUW', 'EAEUDNBNUW', 'FG', 'FGH']
['ABCDEFG', 'ABCDEFGHIJKLMNO', 'CEST', 'DBTSFDEO', 'EOEUDNBNUW', 'EAEUDNBNUW', 'FG', 'FGH']
['ABCDEFG', 'ABCDEFGHIJKLMNO', 'CEST', 'DBTSFDEO', 'EOEUDNBNUW', 'EAEUDNBNUW', 'FGH']
Traceback (most recent call last):
  File "test.py", line 8, in <module>
    if pattern[i] in pattern[i+1]:
IndexError: list index out of range

Ответы на вопрос(11)

Ваш ответ на вопрос