Результаты поиска по запросу "bioinformatics"
Организация вывода моего сценария оболочки в таблицы в текстовом файле
Я работаю со сценарием оболочки Unix, который создает геном, а затем создает филогению. В зависимости от используемого вами ассемблера генома, конечный резул...
Я не знаю, правильно ли я понимаю, но я бы сделал что-то вроде этого (псевдокод):
вая эти входные данные: my $init_seq = "AAAAAAAAAA" #length 10 bp my $sub_rate = 0.003; my $nof_tags = 1000; my @dna = qw( A C G T );Я хочу создать: Тысяча длина-10 меток Коэффициент замещения для каждой позиции в теге составляет ...
Чтение в файле блок за блоком, используя указанный разделитель в Python
У меня есть файл input_file.fa, как это (FASTA формат):
Стиль словаря заменяет несколько элементов
У меня есть большой data.frame символьных данных, которые я хочу преобразовать на основе того, что обычно называют словарем в других языках. В настоящее время я собираюсь сделать это примерно так: foo <- data.frame(snp1 = c("AA", "AG", "AA", ...
Свернуть пересекающиеся области
Я пытаюсь найти способ сворачивать строки с пересекающимися диапазонами, обозначенными столбцами «start» и «stop», и записывать свернутые значения в новые столбцы. Например, у меня есть этот фрейм данных: my.df<- ...
Scanf_s предупреждение? Пропускает вводимые пользователем данные (темы: Рунге-Кутта, Эпидемическое моделирование)
Это мой первый пост, и я должен признать, я ужасен в программировании. Я тот парень в классе, который отрабатывает свой хвост, но никогда не может постичь программирование так же, как остальные мои одноклассники. Поэтому, пожалуйста, будьте ...
Конвертировать CSV в дерево Newick
Итак, у меня есть CSV-файл, где каждая строка представляет иерархические данные в форме: «Тип», «Класс», «Порядок», «Семейство», «Род», «Виды», «Подвиды», «u...
Автоматическая загрузка нескольких файлов в R-Shiny
Я пытаюсь выяснить, как получитьdata.frame подмножество себя, а затем написать файл .csv для каждого подмножества. Я пишуshiny приложение, которое будет генерировать файлы шаблонов для различных инструментов, и мне нужно иметь возможность ...
Самая длинная повторяющаяся (k раз) подстрока
Я знаю, что это несколько запутанная тема, но я достиг предела помощи, которую я могу получить от того, на что уже дан ответ. Это дляРозалинд проект проблемы LREP [http://rosalind.info/problems/lrep/], Я пытаюсь найти самую длинную k-peated ...