Перевод ДНК в белок

Я аспирант биологии, и за последние несколько месяцев я научил себя очень ограниченному количеству питона, чтобы иметь дело с некоторыми данными, которые у меня есть. Я не прошу помощи в выполнении домашних заданий, это для исследовательского ...

Перевод ДНК в белок

Я аспирант биологии, и за последние несколько месяцев я научил себя очень ограниченному количеству питона, чтобы иметь дело с некоторыми данными, которые у м...

Поиск строки, допускающей одно несоответствие в любом месте строки

Я работаю с последовательностями ДНК длиной 25 (см. Примеры ниже). У меня есть список из 230 000, и мне нужно искать каждую последовательность во всем геноме...

В идеале, если это можно решить без ограничения рекурсии, возьмите это. Итеративный подход намного лучше, т.е.

ают строку, и я должен вернуть False, если есть один или несколько недопустимых символов, в противном случае True. Предостережение заключается в том, что я могу использовать только встроенные функции и операции str (например: in, +, indexing, ...

Перекрывающиеся спички в R

Я искал и смог найти этообсуждение на форуме для достижения эффекта перекрывающихся спичек.Я также нашел следующееТАК Говорил о поиске индексов для выполнени...

@rightskewed Знаете ли вы, как устранить пробел в букве? Благодарю.

аюсь нарисоватьлоготипы последовательности используя matplotlib. Весь код доступен насутьСоответствующая часть:

Как построить круговые диаграммы в haploNet Haplotype Networks {pegas}

Оказывается, что прогулки по ДНК не очень полезны на практике, но позволяют интуитивно понятную визуализацию. У меня нет его в руках, но я полагаю, что мой коллега был бы более чем рад предоставить код Matlab, используемый для генерации рисунка ниже.

ужно сгенерировать случайное блуждание на основе последовательности ДНК вируса, учитывая его последовательность пар оснований из 2 тыс. Пар оснований. Последовательность выглядит как «ATGCGTCGTAACGT». Путь должен повернуть направо для A, налево ...

Я не знаю, правильно ли я понимаю, но я бы сделал что-то вроде этого (псевдокод):

вая эти входные данные: my $init_seq = "AAAAAAAAAA" #length 10 bp my $sub_rate = 0.003; my $nof_tags = 1000; my @dna = qw( A C G T );Я хочу создать: Тысяча длина-10 меток Коэффициент замещения для каждой позиции в теге составляет ...