вернуть
аюсь оценить уже выровненные последовательности. Пусть скажут
seq1 = 'PAVKDLGAEG-ASDKGT--SHVVY----------TI-QLASTFE'
seq2 = 'PAVEDLGATG-ANDKGT--LYNIYARNTEGHPRSTV-QLGSTFE'
с заданными параметрами
substitution matrix : blosum62
gap open penalty : -5
gap extension penalty : -1
Я просмотрел кулинарную книгу по биопифону, но все, что я могу получить, это подстановочная матрица blogsum62, но я чувствую, что кто-то уже реализовал такую библиотеку.
Так кто-нибудь может предложить какие-либо библиотеки или кратчайший код, который может решить мою проблему?
Спасибо заранее