вернуть

аюсь оценить уже выровненные последовательности. Пусть скажут

seq1 = 'PAVKDLGAEG-ASDKGT--SHVVY----------TI-QLASTFE'
seq2 = 'PAVEDLGATG-ANDKGT--LYNIYARNTEGHPRSTV-QLGSTFE'

с заданными параметрами

substitution matrix : blosum62
gap open penalty : -5
gap extension penalty : -1

Я просмотрел кулинарную книгу по биопифону, но все, что я могу получить, это подстановочная матрица blogsum62, но я чувствую, что кто-то уже реализовал такую ​​библиотеку.

Так кто-нибудь может предложить какие-либо библиотеки или кратчайший код, который может решить мою проблему?

Спасибо заранее

Ответы на вопрос(1)

Ваш ответ на вопрос