Moja klasa S4 ma metodę, która jest wywoływana wiele razy. Zauważyłem, że czas wykonania jest znacznie wolniejszy niż w przypadku, gdyby podobna funkcja została wywołana niezależnie. Dodałem więc do mojej klasy slot z „funkcją” typu i użyłem tej funkcji zamiast metody. Poniższy przykład pokazuje dwa sposoby na to, a oba działają znacznie szybciej niż odpowiednia metoda. Ponadto przykład sugeruje, że niższa szybkość metody nie wynika z konieczności pobierania danych z klasy, ponieważ funkcje są szybsze nawet wtedy, gdy to robią.

Oczywiście ten sposób robienia rzeczy nie jest idealny. Zastanawiam się, czy istnieje sposób na przyspieszenie wysyłania metod. Jakieś sugestie?

    setClass(Class = "SpeedTest", 
      representation = representation(
        x = "numeric",
        foo1 = "function",
        foo2 = "function"
      )
    )

    speedTest <- function(n) {
      new("SpeedTest",
        x = rnorm(n),
        foo1 = function(z) sqrt(abs(z)),
        foo2 = function() {}
      )
    }

    setGeneric(
      name = "method.foo",
      def = function(object) {standardGeneric("method.foo")}
    )
    setMethod(
      f = "method.foo", 
      signature = "SpeedTest",
      definition = function(object) {
        sqrt(abs(object@x))
      }
    )

    setGeneric(
      name = "create.foo2",
      def = function(object) {standardGeneric("create.foo2")}
    )
    setMethod(
      f = "create.foo2", 
      signature = "SpeedTest",
      definition = function(object) {
        z <- object@x
        object@foo2 <- function() sqrt(abs(z))

        object
      }
    )

    > st <- speedTest(1000)
    > st <- create.foo2(st)
    > 
    > iters <- 100000
    > 
    > system.time(for (i in seq(iters)) method.foo(st)) # slowest by far
       user  system elapsed 
       3.26    0.00    3.27 

    > # much faster 
    > system.time({foo1 <- st@foo1; x <- st@x; for (i in seq(iters)) foo1(x)}) 
       user  system elapsed 
      1.47    0.00    1.46 

    > # retrieving st@x instead of x does not affect speed
    > system.time({foo1 <- st@foo1; for (i in seq(iters)) foo1(st@x)}) 
       user  system elapsed 
       1.47    0.00    1.49 

    > # same speed as foo1 although no explicit argument
    > system.time({foo2 <- st@foo2; for (i in seq(iters)) foo2()}) 
       user  system elapsed 
       1.44    0.00    1.45 

     # Cannot increase speed by using a lambda to "eliminate" the argument of method.foo
     > system.time({foo <- function() method.foo(st); for (i in seq(iters)) foo()})  
        user  system elapsed 
        3.28    0.00    3.29