Результаты поиска по запросу "bioinformatics"
Самая длинная повторяющаяся (k раз) подстрока
Я знаю, что это несколько запутанная тема, но я достиг предела помощи, которую я могу получить от того, на что уже дан ответ. Это дляРозалинд проект проблемы LREP [http://rosalind.info/problems/lrep/], Я пытаюсь найти самую длинную k-peated ...
Scanf_s предупреждение? Пропускает вводимые пользователем данные (темы: Рунге-Кутта, Эпидемическое моделирование)
Это мой первый пост, и я должен признать, я ужасен в программировании. Я тот парень в классе, который отрабатывает свой хвост, но никогда не может постичь программирование так же, как остальные мои одноклассники. Поэтому, пожалуйста, будьте ...
Алгоритм помогите! Быстрый алгоритм поиска строки с партнером
Я ищу быстрый алгоритм для поиска в огромной строке (это последовательность генома организма, состоящая из сотен миллионов миллиардов символов). В этой строке присутствует только 4 символа {A, C, G, T}, и «A» может соединяться только с «T», а ...
Стиль словаря заменяет несколько элементов
У меня есть большой data.frame символьных данных, которые я хочу преобразовать на основе того, что обычно называют словарем в других языках. В настоящее время я собираюсь сделать это примерно так: foo <- data.frame(snp1 = c("AA", "AG", "AA", ...
Топологическая сортировка в этом контексте полезна для проверки того, что граф не содержит циклов - если они действительно возникают, то это означает, что при добавлении новой записи в БД произошла ошибка, или произошла ошибка из-за неправильной репликации данных между экземплярами БД.
приложения реального мира, гдетопологическая сортировкавыполняется набольшой графикразмеры. В некоторых областях, где я представляю, вы можете найти такие примеры: биоинформатика, разрешение зависимостей, базы данных, ...
Отличный ответ и чистый. Спасибо!
я перевариваю последовательность белка с помощью фермента (для вашего любопытства, Asp-N), который расщепляется до белков, кодируемых B или D, в последовательности, состоящей из одной буквы. Мой фактический анализ используетString#scan для ...
вернуть
аюсь оценить уже выровненные последовательности. Пусть скажут seq1 = 'PAVKDLGAEG-ASDKGT--SHVVY----------TI-QLASTFE' seq2 = 'PAVEDLGATG-ANDKGT--LYNIYARNTEGHPRSTV-QLGSTFE'с заданными параметрами substitution matrix : blosum62 gap open penalty : ...
Оказывается, что прогулки по ДНК не очень полезны на практике, но позволяют интуитивно понятную визуализацию. У меня нет его в руках, но я полагаю, что мой коллега был бы более чем рад предоставить код Matlab, используемый для генерации рисунка ниже.
ужно сгенерировать случайное блуждание на основе последовательности ДНК вируса, учитывая его последовательность пар оснований из 2 тыс. Пар оснований. Последовательность выглядит как «ATGCGTCGTAACGT». Путь должен повернуть направо для A, налево ...