Результаты поиска по запросу "bioinformatics"

3 ответа

наверняка, вы могли бы, вероятно, запустить Python / ваш скрипт от имени администратора, чтобы передать ошибку разрешения, хотя

я есть программа на Фортране, и я хочу выполнить ее на python для нескольких файлов. У меня 2000 входных файлов, но в моем коде на Фортране я могу запускать ...

2 ответа

как использовать matchpattern (), чтобы найти определенную аминокислоту в файле с множеством последовательностей (.fasta) в R

У меня есть файл (mydata.txt), который содержит много последовательностей экзонов сFASTA [http://en.wikipedia.org/wiki/Fasta]формат. Я хочу найти стартовые ('atg') и стоповые ('taa', 'tga', 'tag') кодоны для каждой последовательности ДНК (с ...

5 ответов

Как вызвать модуль, написанный с помощью argparse в записной книжке iPython

ТОП публикаций

2 ответа

Как построить положение вдоль хромосомной графики

Я хотел бы создать график, изображающий 14 линейных хромосом для организма, над которым я работаю, в масштабе, с цветными полосами в указанных местах вдоль к...

1 ответ

R скользящее среднее для не временных данных

Это сюжет у меня сейчас. Он генерируется из этого кода: ggplot(data1, aes(x=POS,y=DIFF,colour=GT)) + geom_point() + facet_grid(~ CHROM,scales="free_x",space="free_x") + theme(strip.text.x = element_text(size=40), strip.background ...

1 ответ

Самая длинная повторяющаяся (k раз) подстрока

1 ответ

 функция.

я есть огромный входной файл (типичный образец которого показан ниже какinput): > input CT1 CT2 CT3 1 chr1:200-400 chr1:250-450 chr1:400-800 2 chr1:800-970 chr2:200-500 chr1:700-870 3 chr2:300-700 chr2:600-1000 chr2:700-1400Я хочу обработать ...

0 ответов

Организация вывода моего сценария оболочки в таблицы в текстовом файле

Я работаю со сценарием оболочки Unix, который создает геном, а затем создает филогению. В зависимости от используемого вами ассемблера генома, конечный резул...

11 ответов

Вот еще один вариант рабочего решения:

ько начал изучать Python, и здесь у меня есть отсортированный список последовательностей белков (всего 59 000 последовательностей), и некоторые из них перекрываются. Я сделал список игрушек здесь, например: ABCDE ABCDEFG ABCDEFGH ABCDEFGHIJKLMNO ...

6 ответов

Как мне изменить это на «идиоматический» Perl?