Descubra dónde se ralentiza su código PHP (problema de rendimiento)

Aquí está mi primera pregunta en SO.

Tengo una aplicación interna para mi empresa que recientemente me pidieron mantener. La aplicación está construida en PHP y está bastante bien codificada (OO, DB Abstraction, Smarty) nada WTF-ish.

El problema es que las aplicaciones sonmuy lent.

¿Cómo hago para averiguar qué está ralentizando la aplicación? He optimizado el código para hacer muy pocas consultas a la base de datos, por lo que sé que es el código PHP el que tarda un poco en ejecutarse. Necesito algunas herramientas que me puedan ayudar con esto y necesito idear una estrategia para verificar mi código.

Puedo hacer el trabajo de comprobación / estrategia yo mismo, pero necesito más herramientas PHP para descubrir dónde está fallando mi aplicación.

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