Большая матрица расстояний в кластеризации

Я использую R 3.2.3 на машине с 16 ГБ ОЗУ. У меня есть большая матрица из 30000 строк х 12 столбцов. Я хочу использовать алгоритм иерархической кластеризации...

Цвет метки в дендрограмме, чтобы соответствовать цветам кластера

Как я могу по отдельности раскрасить метки дендрограммы, чтобы они соответствовали цветам кластеров в MATLAB?Вот пример желаемого результата, сгенерированног...

Как рассчитать энтропию кластеризации? Рабочий пример или программный код [закрыто]

Как дать sns.clustermap предварительно вычисленную матрицу расстояний?

Привет ~ действительно спасибо ~ но я меняю ссылку на файл. Так не могли бы вы показать мне демонстрацию ?? Я думаю, что мои данные что-то не так .. ХАХА Я не знаю, где у значения.

ользую пакет DTW в R., и я наконец закончил иерархическую кластеризацию. но я хочу построить кластер временных рядов отдельно, как показано на рисунке ниже.

Использовать матрицу расстояний в scipy.cluster.hierarchy.linkage ()?

У меня есть матрица расстояний n * nM гдеM_ij это расстояние междуobject_i а такжеobject_j, Как и ожидалось, он принимает следующую форму: / 0 M_01 M_02 ... M_0n\ | M_10 0 M_12 ... M_1n | | M_20 M_21 0 ... M2_n | | ... | \ M_n0 M_n2 M_n2 ... 0 ...

Разрезание дендрограммы на n деревьев с минимальным размером кластера в R

Я пытаюсь использовать наемную археологическую кластеризацию (конкретноhclust) разбить набор данных на 10 групп с размерами 100 членов или менее, и ни в одной группе не должно быть более 40% от общей численности населения. Единственный метод, ...

Четвертая цитата выше посвящена, прежде всего, вопросу, который вы добавили в свое редактирование - как решить, когда объединять кластеры, а не создавать «суперкластер», который охватывает оба.

у исследовать отношения между элементами данных в большом массиве. Каждый элемент данных представлен многомерным вектором. Прежде всего, я решил использовать кластеризацию. Я заинтересован в поиске иерархических отношений между кластерами ...

Как получить плоскую кластеризацию, соответствующую цветным кластерам в дендрограмме, созданной scipy

Используя опубликованный кодВот [https://stackoverflow.com/questions/2455761/reordering-matrix-elements-to-reflect-column-and-row-clustering-in-naiive-python/3017704#3017704] Я создал хорошую иерархическую кластеризацию: Допустим, дендрограмма ...

Как получить центроиды из иерархической агломерационной кластеризации SciPy?

Я использую методы иерархической агломерационной кластеризации SciPy для кластеризации матрицы функций m x n, но после того, как кластеризация завершена, я не могу понять, как получить центроид из полученных кластеров. Ниже следует мой код: Y = ...