Resultados de la búsqueda a petición "hierarchical-clustering"
Uso de iGraph en python para la detección de la comunidad y escritura del número de comunidad para cada nodo en CSV
Tengo una red que me gustaría analizar usando eledge_betweenness algoritmo de detección de la comunidad en iGraph. Estoy familiarizado con NetworkX, pero estoy tratando de aprender iGraph debido a sus métodos de detección de comunidad adicionales ...
agrupamiento espacial en R (ejemplo simple)
Tengo este simpledata.frame lat<-c(1,2,3,10,11,12,20,21,22,23) lon<-c(5,6,7,30,31,32,50,51,52,53) data=data.frame(lat,lon)La idea es encontrar los grupos espaciales basados en la distancia Primero, trazo el mapa (lon, ...
Usando R para agrupar basado en la distancia euclidiana y una métrica de enlace completa, ¿demasiados vectores?
Estoy tratando de descubrir cómo leer en una matriz de recuento en R, y luego agruparlo según la distancia euclidiana y una métrica de enlace completa. La matriz original tiene 56,000 filas (genes) y 7 columnas (tratamientos). Quiero ver si hay ...
Matriz de gran distancia en agrupamiento
Estoy ejecutando R 3.2.3 en una máquina con 16 GB de RAM. Tengo una matriz grande de 3,00,000 filas x 12 columnas. Quiero usar un algoritmo de agrupamiento jerárquico en R, así que antes de hacerlo, estoy tratando de crear una matriz ...
Colorea las etiquetas de las marcas en un dendrograma para que coincida con los colores del grupo
¿Cómo puedo colorear individualmente las etiquetas de un dendrograma para que coincidan con los colores de los grupos en MATLAB? Aquí hay un ejemplo de salida deseada generada usando el código en mi respuesta a continuación (tenga en cuenta que ...
¿Cómo calcular la entropía de agrupamiento? Un ejemplo de trabajo o código de software [cerrado]
Me gustaría calcular la entropía de este esquema de ejemplo http://nlp.stanford.edu/IR-book/html/htmledition/evaluation-of-clustering-1.html [http://nlp.stanford.edu/IR-book/html/htmledition/evaluation-of-clustering-1.html] ...
Heurística de clusterización jerárquica
Quiero explorar las relaciones entre los elementos de datos en una gran variedad. Cada elemento de datos representado por un vector multidimensional. En primer lugar, he decidido usar la agrupación. Estoy interesado en encontrar relaciones ...
Cómo obtener agrupaciones planas correspondientes a agrupaciones de colores en el dendrograma creado por scipy
Utilizando el código publicadoaqu [https://stackoverflow.com/questions/2455761/reordering-matrix-elements-to-reflect-column-and-row-clustering-in-naiive-python/3017704#3017704] , Creé un buen agrupamiento jerárquico: Digamos que el ...
¿Cómo obtener los centroides de la agrupación jerárquica aglomerativa de SciPy?
Estoy usando los métodos de agrupación aglomerativa jerárquica de SciPy para agrupar una matriz de características m x n, pero después de que se completa la agrupación, parece que no puedo entender cómo obtener el centroide de los ...
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