Suchergebnisse für Anfrage "hierarchical-clustering"

6 die antwort

Verwenden Sie R, um basierend auf dem euklidischen Abstand und einer vollständigen Verknüpfungsmetrik zu viele Vektoren zu gruppieren?

Ich versuche herauszufinden, wie man eine Zählmatrix in R einliest und dann basierend auf dem euklidischen Abstand und einer vollständigen Verbindungsmetrik gruppiert. Die ursprüngliche Matrix hat 56.000 Zeilen (Gene) und 7 ...

2 die antwort

Große Distanzmatrix im Clustering

Ich führe R 3.2.3 auf einem Computer mit 16 GB RAM aus. Ich habe eine große Matrix von 3.00.000 Zeilen x 12 Spalten. Ich möchte einen hierarchischen Clustering-Algorithmus in R verwenden. Bevor ich das tue, versuche ich, eine Distanzmatrix zu ...

2 die antwort

Färben Sie die Häkchen in einem Dendrogramm so ein, dass sie mit den Clusterfarben übereinstimmen.

Wie kann ich die Beschriftungen eines Dendrogramms individuell einfärben, damit sie mit den Farben der Cluster in MATLAB übereinstimmen? Hier ist ein Beispiel für eine gewünschte Ausgabe, die mit dem Code in meiner Antwort unten generiert wurde ...

TOP-Veröffentlichungen

4 die antwort

Wie berechnet man die Cluster-Entropie? Ein funktionierendes Beispiel oder ein Software-Code [closed]

Ich möchte die Entropie dieses Beispielschemas berechnen http: //nlp.stanford.edu/IR-book/html/htmledition/evaluation-of-clustering-1.htm [http://nlp.stanford.edu/IR-book/html/htmledition/evaluation-of-clustering-1.html] ...

2 die antwort

Wie kann man sns.clustermap eine vorberechnete Distanzmatrix geben?

enn ich Dendrogramme und Heatmaps mache, verwende ich normalerweise eine Distanzmatrix und mache eine Reihe vonSciPy Zeug. Ich möchte @ ausprobierSeaborn aberSeaborn möchte meine Daten in rechteckiger Form (Zeilen = Stichproben, Spalten = ...