Resultados da pesquisa a pedido "hierarchical-clustering"

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Usando o iGraph em python para detecção da comunidade e gravação do número da comunidade para cada nó no CSV

Eu tenho uma rede que gostaria de analisar usando oedge_betweenness algoritmo de detecção de comunidade no iGraph. Estou familiarizado com o NetworkX, mas estou tentando aprender o iGraph por causa dos métodos adicionais de detecção da comunidade ...

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agrupamento espacial em R (exemplo simples)

Eu tenho esse simplesdata.frame lat<-c(1,2,3,10,11,12,20,21,22,23) lon<-c(5,6,7,30,31,32,50,51,52,53) data=data.frame(lat,lon)A idéia é encontrar os clusters espaciais com base na distância Primeiro, traço o mapa (lon, ...

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Usando R para agrupar com base na distância euclidiana e em uma métrica de ligação completa, há muitos vetores?

Estou tentando descobrir como ler em uma matriz de contagens em R e, em seguida, agrupar com base na distância euclidiana e em uma métrica de ligação completa. A matriz original possui 56.000 linhas (genes) e 7 colunas (tratamentos). Quero ver se ...

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Matriz de grande distância em cluster

Estou executando o R 3.2.3 em uma máquina com 16 GB de RAM. Eu tenho uma grande matriz de 3.00.000 linhas x 12 colunas. Eu quero usar um algoritmo de cluster hierárquico em R, então, antes de fazer isso, estou tentando criar uma matriz ...

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Colora as etiquetas de escala em um dendograma para corresponder às cores do cluster

Como posso colorir individualmente os rótulos de um dendrograma para que correspondam às cores dos clusters no MATLAB? Aqui está um exemplo de saída desejada gerada usando o código na minha resposta abaixo (observe que os rótulos são apenas as ...

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Como calcular a entropia de cluster? Um exemplo de trabalho ou código de software [fechado]

Eu gostaria de calcular a entropia deste esquema de exemplo http://nlp.stanford.edu/IR-book/html/htmledition/evaluation-of-clustering-1.html [http://nlp.stanford.edu/IR-book/html/htmledition/evaluation-of-clustering-1.html] ...

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Heurísticas hierárquicas de clusterização

Eu quero explorar as relações entre itens de dados em uma grande variedade. Cada item de dados representado pelo vetor multidimensional. Primeiro de tudo, eu decidi usar clusterização. Estou interessado em encontrar relações hierárquicas entre ...

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Como obter agrupamentos simples correspondentes a agrupamentos de cores no dendrograma criado por scipy

Usando o código postadoaqu [https://stackoverflow.com/questions/2455761/reordering-matrix-elements-to-reflect-column-and-row-clustering-in-naiive-python/3017704#3017704] , Criei um bom cluster hierárquico: Digamos que o dendrograma à esquerda ...

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Como obter centróides do cluster aglomerado hierárquico do SciPy?

Estou usando os métodos de cluster aglomerado hierárquico do SciPy para agrupar uma matriz m x n de recursos, mas depois que o cluster está completo, não consigo descobrir como obter o centróide dos clusters resultantes. Abaixo segue o meu ...