Resultados de la búsqueda a petición "dna-sequence"
Traducción de ADN a Proteína
Soy un estudiante graduado de biología y aprendí por mi mismo una cantidad muy limitada de python en los últimos meses para tratar algunos de los datos que t...
Logotipos de secuencia en matplotlib: alinear xticks
Estoy tratando de dibujarlogotipos de secuencia [https://en.wikipedia.org/wiki/Sequence_logo]usando matplotlib. El código completo está disponible enesencia [https://gist.github.com/saketkc/45559a011a354a9cca2fbe4e208dde61] La porción relevante ...
Partidos superpuestos en R
He buscado y pude encontrar estodiscusión en el foro [https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2008-December/182576.html]para lograr el efecto de coincidencias superpuestas. También encontré lo ...
¿Cómo trazar un gráfico de genes para una secuencia de ADN, por ejemplo ATGCCGCTGCGC?
Necesito generar una caminata aleatoria basada en la secuencia de ADN de un virus, dada su secuencia de pares de bases de 2k pares de bases. La secuencia se parece a "ATGCGTCGTAACGT". El camino debe girar a la derecha para una A, a la izquierda ...
Caracteres válidos en una cadena
Me dan una cadena y tengo que devolver False si hay uno o más caracteres no válidos, de lo contrario, True. La advertencia es que solo puedo incorporar funciones y operaciones str (por ejemplo: in, +, indexing, len) y recursión. Lo que tengo ...
Busque una cadena que permita una falta de coincidencia en cualquier ubicación de la cadena
Estoy trabajando con secuencias de ADN de longitud 25 (ver ejemplos a continuación). Tengo una lista de 230,000 y necesito buscar cada secuencia en todo el genoma (parásito toxoplasma gondii). No estoy seguro de qué tan grande es el genoma, pero ...
ecuencia de ADN sintético generador con tasa de sustituci
Dados estas entradas: my $init_seq = "AAAAAAAAAA" #length 10 bp my $sub_rate = 0.003; my $nof_tags = 1000; my @dna = qw( A C G T ); Quiero generar: Mil etiquetas de longitud 10 a tasa de sustitución para cada posición en una etiqueta es ...
Cómo trazar gráficos circulares en haploNet Haplotype Networks {pegas}
Estoy tratando de usar la función haploNet de {pegas} para trazar una red de haplotipos, pero estoy teniendo problemas para poner haplotipos iguales de diferentes poblaciones en un mismo gráfico. Puedo construir una red de haplotipos con el ...