Результаты поиска по запросу "bioinformatics"
Как мне изменить это на «идиоматический» Perl?
Я начинаю углубляться в Perl, но у меня возникают проблемы с написанием кода "Perl-ly" вместо написания C на Perl. Как я могу изменить следующий код, чтобы использовать больше идиом Perl, и как мне учиться идиомам? Просто объяснение того, что он ...
Свернуть пересекающиеся области
Я пытаюсь найти способ сворачивать строки с пересекающимися диапазонами, обозначенными столбцами «start» и «stop», и записывать свернутые значения в новые столбцы. Например, у меня есть этот фрейм данных: my.df<- ...
как использовать matchpattern (), чтобы найти определенную аминокислоту в файле с множеством последовательностей (.fasta) в R
У меня есть файл (mydata.txt), который содержит много последовательностей экзонов сFASTA [http://en.wikipedia.org/wiki/Fasta]формат. Я хочу найти стартовые ('atg') и стоповые ('taa', 'tga', 'tag') кодоны для каждой последовательности ДНК (с ...
Как удалить строки с 0 значениями, используя R
Привет, я использую матрицу экспрессии генов, рассчитываю фрагменты для вычисления дифференциально экспрессированных генов Я хотел бы знать, как удалить строки, значения которых равны 0. Тогда мой набор данных будет компактным, и для последующего ...
Автоматическая загрузка нескольких файлов в R-Shiny
Я пытаюсь выяснить, как получитьdata.frame подмножество себя, а затем написать файл .csv для каждого подмножества. Я пишуshiny приложение, которое будет генерировать файлы шаблонов для различных инструментов, и мне нужно иметь возможность ...
R скользящее среднее для не временных данных
Это сюжет у меня сейчас. Он генерируется из этого кода: ggplot(data1, aes(x=POS,y=DIFF,colour=GT)) + geom_point() + facet_grid(~ CHROM,scales="free_x",space="free_x") + theme(strip.text.x = element_text(size=40), strip.background ...