Tento pontuar as seqüências já alinhadas. Deixe dize

seq1 = 'PAVKDLGAEG-ASDKGT--SHVVY----------TI-QLASTFE'
seq2 = 'PAVEDLGATG-ANDKGT--LYNIYARNTEGHPRSTV-QLGSTFE'

com os parâmetros fornecidos

substitution matrix : blosum62
gap open penalty : -5
gap extension penalty : -1

Examinei o livro de receitas biopython, mas tudo o que consigo obter é blogsum62 de matriz de substituição, mas acho que já deve ter alguém que já implementou esse tipo de bibliotec

Alguém pode sugerir bibliotecas ou códigos mais curtos que possam resolver meu problem

Thx antecipadamente