Depois de atualizar para o bootstrap 2.3.0, notei um comportamento estranho do popover tooltip.

Se você entrar no campo e tentar sair, a dica de ferramenta desapareceria e ocultaria o campo de entrada. Esse problema ocorre apenas com a versão mais recente do bootstrap, não sei exatamente o que foi alterado, mas o 2.2.2 funciona bem com o Prototype.

jQuery.noConflict();
jQuery('input[data-content]').popover({
    trigger: 'focus'
});

Aqui está o exemplo de trabalho:http://jsfiddle.net/U6EDs/4/