Zapętlanie zawartości pliku w Bash
Jak iterować po każdej linii pliku tekstowego za pomocąGrzmotnąć?
Z tym skryptem:
echo "Start!"
for p in (peptides.txt)
do
echo "${p}"
done
Otrzymuję to wyjście na ekranie:
Start!
./runPep.sh: line 3: syntax error near unexpected token `('
./runPep.sh: line 3: `for p in (peptides.txt)'
(Później chcę zrobić coś bardziej skomplikowanego$p
niż tylko wyjście na ekran.)
Zmienna środowiskowaMUSZLA jest (z env):
SHELL=/bin/bash
/bin/bash --version
wydajność:
GNU bash, version 3.1.17(1)-release (x86_64-suse-linux-gnu)
Copyright (C) 2005 Free Software Foundation, Inc.
cat /proc/version
wydajność:
Linux version 2.6.18.2-34-default (geeko@buildhost) (gcc version 4.1.2 20061115 (prerelease) (SUSE Linux)) #1 SMP Mon Nov 27 11:46:27 UTC 2006
Plik peptides.txt zawiera:
RKEKNVQ
IPKKLLQK
QYFHQLEKMNVK
IPKKLLQK
GDLSTALEVAIDCYEK
QYFHQLEKMNVKIPENIYR
RKEKNVQ
VLAKHGKLQDAIN
ILGFMK
LEDVALQILL