Resultados de la búsqueda a petición "fasta"
Lectura en archivo bloque por bloque usando el delimitador especificado en python
Tengo un archivo input_file.fa como este (FASTA [https://en.wikipedia.org/wiki/FASTA_format]formato): > header1 description data data data >header2 description more data data data Quiero leer en el archivo un fragmento a la vez, para que cada ...
Perl6: ¿Cuál es la mejor manera de manejar archivos muy grandes?
La semana pasada decidí probar Perl6 y comencé a reimplementar uno de mi programa. Debo decir que Perl6 es muy fácil para la programación de objetos, un aspecto muy doloroso para mí en Perl5. Mi programa tiene que leer y almacenar archivos ...
Convertir FASTQ a FASTA con SED / AWK
Tengo datos que siempre vienen en el bloque de cuatro en el siguiente formato (llamado FASTQ):
cómo usar matchpattern () para encontrar cierto aminoácido en un archivo con muchas secuencias (.fasta) en R
Tengo un archivo (mydata.txt) que contiene muchas secuencias de exones confasta formato. Quiero encontrar los codones de inicio ('atg') y parada (...
Utilizando un archivo .fasta para calcular el contenido relativo de las secuencias
Así que soy el 'novato' que soy, me introdujeron a la programación a través de Perl recientemente, todavía me estoy acostumbrando a todo esto. Tengo un archivo .fasta que tengo que usar, aunque no estoy seguro si puedo abrirlo o si tengo que ...
analizar un archivo fasta usando un generador (python)
Estoy intentando analizar un archivo fasta grande y me encuentro con errores de falta de memoria. Se agradecerían algunas sugerencias para mejorar el manejo de datos. Actualmente, el programa imprime correctamente los nombres, ...