Resultados de la búsqueda a petición "bioconductor"

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El paquete CRAN depende del error de instalación del paquete de bioconductor

Gestiono las dependencias, sugerencias e importaciones del archivo de descripción. y finalmente presento mi paquete a

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Encuentra regiones superpuestas y extrae el valor respectivo

¿Cómo encuentra las coordenadas superpuestas y extrae los valores seg.mean respectivos para la región superpuesta? data1 Rl pValue chr start end CNA 2 2.594433 6 129740000 129780000 gain 2 3.941399 6 130080000 130380000 gain 1 1.992114 10 ...

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ruta de instalación no escribible R, incapaz de actualizar paquetes

Estoy tratando de instalar Bioconductor en R, usando el código en su sitio web. Cuando escribo el código (ver abajo) recibo un mensaje de error que dice que algunos paquetes no se pueden actualizar, la ruta de instalación no se puede escribir. > ...

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Cómo realizar el agrupamiento sin eliminar filas donde NA está presente en R

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R Error de instalación del bioconductor - El inicio de línea '<DOCTYPE html PUBLI ...' está mal formado

Tengo problemas para instalar los paquetes de bioconductores en R. Esto es en MacOSX, una instalación nueva de R 2.15 y el uso de bioconductor 1.4.4. La tran...

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Los paquetes R no se compilan con gcc

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¿Cómo puedo convertir Ensembl ID a símbolo de gen en R?

Tengo un data.frame que contiene ID de Ensembl en una columna; Me gustaría encontrar los símbolos genéticos correspondientes para los valores de esa columna y agregarlos a una nueva columna en mi marco de datos. Utilicé bioMaRt pero no pude ...

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cómo usar matchpattern () para encontrar cierto aminoácido en un archivo con muchas secuencias (.fasta) en R

Tengo un archivo (mydata.txt) que contiene muchas secuencias de exones confasta formato. Quiero encontrar los codones de inicio (&#39;atg&#39;) y parada (&#3...

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en R cómo obtener mensajes de error en inglés

Estoy probando algunos tutoriales sobre bioconductor; pero recibo mensajes de error, que me gustaría buscar / enviar; desafortunadamente, como R está instala...

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R en MacOS Error: memoria de vector agotada (¿límite alcanzado?)

Estoy tratando de ejecutar un script R (en particular, estoy usando la función "getLineages" del paquete Bioconductor,Hond [https://www.bioconductor.org/packages/devel/bioc/html/slingshot.html]. Me pregunto por qué aparece el error "memoria de ...