Результаты поиска по запросу "bioinformatics"
Я не знаю, правильно ли я понимаю, но я бы сделал что-то вроде этого (псевдокод):
вая эти входные данные: my $init_seq = "AAAAAAAAAA" #length 10 bp my $sub_rate = 0.003; my $nof_tags = 1000; my @dna = qw( A C G T );Я хочу создать: Тысяча длина-10 меток Коэффициент замещения для каждой позиции в теге составляет ...
Отличный ответ и чистый. Спасибо!
я перевариваю последовательность белка с помощью фермента (для вашего любопытства, Asp-N), который расщепляется до белков, кодируемых B или D, в последовательности, состоящей из одной буквы. Мой фактический анализ используетString#scan для ...
Топологическая сортировка в этом контексте полезна для проверки того, что граф не содержит циклов - если они действительно возникают, то это означает, что при добавлении новой записи в БД произошла ошибка, или произошла ошибка из-за неправильной репликации данных между экземплярами БД.
приложения реального мира, гдетопологическая сортировкавыполняется набольшой графикразмеры. В некоторых областях, где я представляю, вы можете найти такие примеры: биоинформатика, разрешение зависимостей, базы данных, ...
Запрос записей службы DNS для поиска имени хоста и TCP / IP
В статье оИдентификаторы науки о жизни(видетьLSID Tester, инструмент для тестирования сервисов разрешения Life Science Identifier [http://www.scfbm.org/content/3/1/2]Доктор Родерик Д.М. Учитывая LSID urn: lsid **: ubio.org **: namebank: 11815, ...
Стиль словаря заменяет несколько элементов
У меня есть большой data.frame символьных данных, которые я хочу преобразовать на основе того, что обычно называют словарем в других языках. В настоящее время я собираюсь сделать это примерно так: foo <- data.frame(snp1 = c("AA", "AG", "AA", ...
Алгоритм помогите! Быстрый алгоритм поиска строки с партнером
Я ищу быстрый алгоритм для поиска в огромной строке (это последовательность генома организма, состоящая из сотен миллионов миллиардов символов). В этой строке присутствует только 4 символа {A, C, G, T}, и «A» может соединяться только с «T», а ...
Scanf_s предупреждение? Пропускает вводимые пользователем данные (темы: Рунге-Кутта, Эпидемическое моделирование)
Это мой первый пост, и я должен признать, я ужасен в программировании. Я тот парень в классе, который отрабатывает свой хвост, но никогда не может постичь программирование так же, как остальные мои одноклассники. Поэтому, пожалуйста, будьте ...
Самая длинная повторяющаяся (k раз) подстрока
Я знаю, что это несколько запутанная тема, но я достиг предела помощи, которую я могу получить от того, на что уже дан ответ. Это дляРозалинд проект проблемы LREP [http://rosalind.info/problems/lrep/], Я пытаюсь найти самую длинную k-peated ...
Фильтрация файла CSV в python
Я скачал этоCSV-файл [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gv/mhc/ihwg.cgi?cmd=page&user_id=0&probe_id=0&source_id=0&locus_id=0&locus_group=1&proto_id=0&kit_id=0&page=RAmain] , которая создает электронную таблицу информации о генах. Важно то, что ...
Какие языки функционального программирования имеют библиотеки биоинформатики? [закрыто]
На каких языках функционального программирования легко доступны библиотеки биоинформатики? (Не включайте мультипарадигмальные языки, такие какРубин [http://en.wikipedia.org/wiki/Ruby_%28programming_language%29]) ОбновитьТакже приветствуется ...