Результаты поиска по запросу "bioinformatics"
Организация вывода моего сценария оболочки в таблицы в текстовом файле
Я работаю со сценарием оболочки Unix, который создает геном, а затем создает филогению. В зависимости от используемого вами ассемблера генома, конечный резул...
Как я могу преобразовать Ensembl ID в символ гена в R?
У меня есть data.frame, содержащий идентификаторы Ensembl в одном столбце; Я хотел бы найти соответствующие генные символы для значений этого столбца и добав...
Конвертировать CSV в дерево Newick
Итак, у меня есть CSV-файл, где каждая строка представляет иерархические данные в форме: «Тип», «Класс», «Порядок», «Семейство», «Род», «Виды», «Подвиды», «u...
Объединить перекрывающиеся числовые диапазоны в непрерывные диапазоны
Я пытаюсь объединить диапазон геномных координат в непрерывные диапазоны с дополнительной опцией для объединения через промежутки.Например, если бы у меня бы...
AWK: извлечь строки, если столбец в файле 1 попадает в диапазон, объявленный в двух столбцах другого файла
В настоящее время я борюсь с проблемой AWK, которую я еще не смог решить. У меня есть один огромный файл (30 ГБ) с геномными данными, который содержит список...
Создайте «индекс» для каждого элемента группы с data.table
Мои данные сгруппированы по идентификаторам в V6 и упорядочены по позиции (V1: V3):
R скользящее среднее для не временных данных
Это сюжет у меня сейчас. Он генерируется из этого кода: ggplot(data1, aes(x=POS,y=DIFF,colour=GT)) + geom_point() + facet_grid(~ CHROM,scales="free_x",space="free_x") + theme(strip.text.x = element_text(size=40), strip.background ...