Biblioteca de imágenes de Python - Hacer transparente el área de la imagen

Tengo una pregunta rápida para alguien que conoce la Biblioteca de imágenes de Python mejor que yo. Tengo una imagen png con un canal alfa, y quiero que las dos filas superiores de píxeles sean completamente transparentes. ¡Eso es! Hasta ahora, mis esfuerzos hacen que las dos filas superiores sean transparentes, pero la imagen original pierde su información del canal alfa. ¿Alguien sabe la mejor manera de lograr esto?

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