Hace un par de semanas hice esta pregunta en elForos de soporte de RStudio, pero no ha sido abordado allí, así que estoy tratando aquí.

Estoy usando RStudio 0.97.248 (versión actual) en Windows 7 y R 2.15.2.

Cuando abro RStudio, después de la información de la versión R normal, se me presentan dos errores:

Error in packageVersion("knitr") : package ‘knitr’ not found  Error in
packageVersion("Rcpp") : package ‘Rcpp’ not found

pero puedo cargar ambos paquetes sin problemas usandorequire(). (Es decir, después de los errores al iniciar RStudion, puedo ingresarrequire(knitr) yknitr se cargará con éxito. El problema real es que no puedo usar, por ejemplo, el comando Knit HTML en un documento Markdown R, incluso después de cargar manualmenteknitr. Si yo cargaknitr conrequire(knitr), luego abra un nuevo documento de Markdown R (para el que RStudio está predeterminado en una plantilla agradable), guárdelo e intente Knit HTML, RStudio me da un pequeño mensaje de error en la parte superior del documento R Markdown que

R Markdown requiere el paquete knitr (versión 0.5 o superior)

Supongo que RStudio no está buscando las rutas de biblioteca correctas.

> .libPaths()
[1] "\\\\gregorp.homedir.nebula.washington.edu/homes/R/win-library/2.15"
[2] "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"                               
[3] "C:/Program Files/RStudio/R/library"

con la primera entrada donde puedo instalar los paquetes (y misRcpp yknitr instalaciones ubicadas). Creo que estoy teniendo el mismo problema queeste chico, pero esa discusión es incoherente.

Intenté agregar la línea

.Library.site <- "\\\\gregorp.homedir.nebula.washington.edu/homes/R/win-library/2.15"

para miRprofile.site archivo en miR-2.15.2/etc/ Carpeta, pero el problema persiste.