XCode 4.5.1, se espera que las ventanas de la aplicación tengan un controlador de vista raíz al final del inicio de la aplicación

He actualizado miXCode a4.5.1 con el fin de depurar en mi nuevo iPad conIOS 6.0.1. Después de eso recibo este error en la consola después de compilar:

Se espera que las ventanas de la aplicación tengan un controlador de vista raíz al final del inicio de la aplicación

Y mi aplicación entra en una pantalla diferente de la principal y los botones no funcionan en absoluto.

En la versión anterior deXCode funcionó como un encanto.

¿Alguna idea de lo que está pasando?

En el delegado de la aplicación tengo esto:

- (BOOL)application:(UIApplication *)application didFinishLaunchingWithOptions:(NSDictionary *)launchOptions {    

    // Override point for customization after application launch.

    // Add the view controller's view to the window and display.


    [self.window addSubview:viewController.view];

    [self.window makeKeyAndVisible];

    return YES;
}

Solo para actualizar, la única forma en que podía obtener mi aplicación de nuevo era eliminar Xcode 4.5.1 y volver a Xcode 4.4.1. Parece que hay un problema en el archivo .xib y el generador de interfaces no puede vincular correctamente los objetos en las versiones más nuevas. No se porque

Un dato curioso, antes de actualizar el XCode no pude ejecutar mi aplicación en el ipad con iOS 6.0.1 (estaba compilando para iOS 5.1).

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