Rekursive Generatoren in Python

Ich habe eine Funktion geschrieben, die einen Generator zurückgibt, der jede eindeutige Kombination von Teilzeichenfolgen einer bestimmten Länge enthält, die...

R Fehler bei der Installation des Bioconductors - Die Leitung, die mit '<DOCTYPE html PUBLI…' beginnt, ist fehlerhaft

Ich habe Probleme bei der Installation von Bioconductor-Paketen in R. Dies ist auf MacOSX, einer Neuinstallation von R 2.15, und der Verwendung von Bioconduc...

Längste wiederholte (k-mal) Teilzeichenfolge

Ich weiß, dass dies ein etwas ausgetretenes Thema ist, aber ich habe die Grenze der Hilfe erreicht, die ich aus den bereits beantworteten Fragen ziehen kann....

So entfernen Sie Zeilen mit 0-Werten mit R

Convert csv zu Newick Baum

So habe ich eine CSV-Datei, in der jede Zeile hierarchische Daten in Form von "Phylum", "Class", "Order", "Family", "Genus", "Species", "Subspecies", "unique_gi" darstellt. Ich möchte dies in den klassischen @ umwandeNewick ...

Filtern einer CSV-Datei in Python

Schnittbereiche reduzieren

Ich versuche, einen Weg zu finden, um Zeilen mit sich überschneidenden Bereichen, die durch &quot;Start&quot; - und &quot;Stopp&quot; -Spalten gekennzeichnet...

wie man mit matchpattern () bestimmte Aminosäuren in einer Datei mit vielen Sequenzen (.fasta) in R findet

Ich habe eine Datei (mydata.txt), die viele Exon-Sequenzen mit enthältFasta Format. Ich möchte Start (&#39;atg&#39;) und Stop (&#39;taa&#39;, &#39;tga&#39;, ...

Automatischer Download mehrerer Dateien in R-Shiny

Ich versuche herauszufinden, wie man einen bekommtdata.frame um sich selbst zu unterteilen und dann eine CSV-Datei für jede Untergruppe zu schreiben. Ich schreibe eineshiny App, die Vorlagendateien für verschiedene Instrumente generiert, und ich ...

AWK: Zeilen extrahieren, wenn die Spalte in Datei 1 in einen Bereich fällt, der in zwei Spalten in einer anderen Datei deklariert ist

Derzeit habe ich mit einem AWK-Problem zu kämpfen, das ich noch nicht lösen konnte. Ich habe eine riesige Datei (30 GB) mit Genomdaten, die eine Liste mit Positionen (in Spalte 1 und 2 deklariert) und eine zweite Liste mit einer Reihe von ...