Resultados de la búsqueda a petición "bioinformatics"
R Error de instalación del bioconductor - El inicio de línea '<DOCTYPE html PUBLI ...' está mal formado
Tengo problemas para instalar los paquetes de bioconductores en R. Esto es en MacOSX, una instalación nueva de R 2.15 y el uso de bioconductor 1.4.4. La tran...
La subcadena más repetida (k veces)
Sé que este es un tema un tanto trillado, pero he llegado al límite de ayuda que puedo obtener de lo que ya se ha respondido.Esto es para elProblema del proy...
Convertir csv a árbol Newick
Así que tengo un archivo csv donde cada línea representa datos jerárquicos en la forma: 'Filo', 'Clase', 'Orden', 'Familia', 'Género', 'Especie', 'Subespecie', 'unique_gi' Me gustaría convertir esto al clásicoFormato de árbol ...
¿Cómo puedo convertir Ensembl ID a símbolo de gen en R?
Tengo un data.frame que contiene ID de Ensembl en una columna; Me gustaría encontrar los símbolos genéticos correspondientes para los valores de esa columna y agregarlos a una nueva columna en mi marco de datos. Utilicé bioMaRt pero no pude ...
todas las terminaciones de formas de palabras posibles de la raíz de una palabra (biomédica)
Estoy familiarizado con la derivación de palabras y la finalización del paquete tm en R. Estoy tratando de encontrar un método rápido y sucio para encontrar todas las variantes de una palabra dada (dentro de algún corpus). Por ejemplo, me ...
Procesando el archivo de entrada basado en la superposición de rango
Tengo un gran archivo de entrada (una muestra representativa de la cual se muestra a continuación comoinput): > input CT1 CT2 CT3 1 chr1:200-400 chr1:250-450 chr1:400-800 2 chr1:800-970 chr2:200-500 chr1:700-870 3 chr2:300-700 chr2:600-1000 ...
Filtrado de un archivo CSV en Python
He descargado estoarchivo csv, que crea una hoja de cálculo de información genética. Lo importante es que en el