Ich habe ein sehr ärgerliches Problem mit einem gestapelten Balkendiagramm, das mit erstellt wurdeggplot2. Zuvor wurden einige ähnliche Fragen gestellt, aber nachdem ich den Beispielcode durchgesehen habe, kann ich nicht herausfinden, was ich falsch mache.

Ich möchte das Diagramm so gestalten, dass die Balken in der folgenden Reihenfolge gestapelt werdenBiogeographic.affinity: (Von oben nach unten = Bassian, Weit verbreitet, Torresian und Eyrean). Die Farben der Balken sollten sein: (Bassian = drakgrau, Widespread = hellgrau, Torresian = weiß und Eyrean = schwarz).

So sieht der Datensatz aus:

  biogeo
       Site Biogeographic.affinity Rank Number.of.species Total.Species    Percent
    1     A                Bassian    1                 1           121  0.8264463
    2     A                 Eyrean    4                39           121 32.2314050
    3     A              Torresian    3                62           121 51.2396694
    4     A             Widespread    2                19           121 15.7024793
    5    DD                Bassian    1                 1           128  0.7812500
    6    DD                 Eyrean    4                46           128 35.9375000
    7    DD              Torresian    3                63           128 49.2187500
    8    DD             Widespread    2                18           128 14.0625000
    9   E_W                Bassian    1                 1           136  0.7352941
    10  E_W                 Eyrean    4                54           136 39.7058824
    11  E_W              Torresian    3                65           136 47.7941176
    12  E_W             Widespread    2                16           136 11.7647059
    13   KS                Bassian    1                 2           145  1.3793103
    14   KS                 Eyrean    4                63           145 43.4482759
    15   KS              Torresian    3                62           145 42.7586207
    16   KS             Widespread    2                18           145 12.4137931
    17 Z_Ka                Bassian    1                 1           110  0.9090909
    18 Z_Ka                 Eyrean    4                64           110 58.1818182
    19 Z_Ka              Torresian    3                31           110 28.1818182
    20 Z_Ka             Widespread    2                14           110 12.7272727

Dies ist der Code, den ich bisher geschrieben habe (einschließlich einiger meiner fehlgeschlagenen Versuche, das Problem zu beheben).

 ggplot(data=biogeo, aes(x=Site, y=Percent, fill=Biogeographic.affinity)) + geom_bar(stat="identity", colour="black")+ 
  scale_fill_grey() + ylab("Percent") + xlab("Location") +       
  theme_bw()+ theme(panel.grid.minor = element_blank()) 

Dies gibt die grundlegende Grafik, aber die Farben und die Reihenfolge sind immer noch falsch. Um die Reihenfolge zu korrigieren habe ich versucht, aber das hat nichts geändert (FRUSTRATED) !:

newone <- transform(biogeo, Biogeographic.affinity  = factor(Biogeographic.affinity ), Rank = factor(Rank, levels = 1:4))

Was Farbwechsel angeht, habe ich versucht und scheint zu funktionieren, aber es sieht alles so aus, als ob die Reihenfolge immer noch falsch ist!

cols<- c("Bassian"="darkgrey","Widespread"="lightgrey", "Torresian"="white", "Eyrean"="black") #designates the colors of the bars 
ggplot(data=newone, aes(x=Site, y=Percent, fill=Biogeographic.affinity)) + geom_bar(stat="identity", colour="black")+ 
  scale_fill_manual(values = cols) + ylab("Percent") + xlab("Location") +       
  theme_bw()+ theme(panel.grid.minor = element_blank()) 

Bitte helfen Sie.