Результаты поиска по запросу "bioinformatics"
Автоматическая загрузка нескольких файлов в R-Shiny
Я пытаюсь выяснить, как получитьdata.frame подмножество себя, а затем написать файл .csv для каждого подмножества. Я пишуshiny приложение, которое будет генерировать файлы шаблонов для различных инструментов, и мне нужно иметь возможность ...
Автоматическая загрузка нескольких файлов в R-Shiny
я пытаюсь понять, как получить
Как удалить строки с 0 значениями, используя R
Привет, я использую матрицу экспрессии генов, рассчитываю фрагменты для вычисления дифференциально экспрессированных генов Я хотел бы знать, как удалить строки, значения которых равны 0. Тогда мой набор данных будет компактным, и для последующего ...
как использовать matchpattern (), чтобы найти определенную аминокислоту в файле с множеством последовательностей (.fasta) в R
У меня есть файл (mydata.txt), который содержит много последовательностей экзонов сFASTA [http://en.wikipedia.org/wiki/Fasta]формат. Я хочу найти стартовые ('atg') и стоповые ('taa', 'tga', 'tag') кодоны для каждой последовательности ДНК (с ...
Свернуть пересекающиеся области
Я пытаюсь найти способ сворачивать строки с пересекающимися диапазонами, обозначенными столбцами «start» и «stop», и записывать свернутые значения в новые столбцы. Например, у меня есть этот фрейм данных: my.df<- ...
Фильтрация файла CSV в python
Я скачал этоCSV-файл [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gv/mhc/ihwg.cgi?cmd=page&user_id=0&probe_id=0&source_id=0&locus_id=0&locus_group=1&proto_id=0&kit_id=0&page=RAmain] , которая создает электронную таблицу информации о генах. Важно то, что ...