Resultados da pesquisa a pedido "dendrogram"
Convertendo o ndarray gerado pelo hcluster em uma string Newick para uso com o pacote ete2
Tenho uma lista de vetores criados executando: import hcluster import numpy as np from ete2 import Tree vecs = [np.array(i) for i in document_list]where document_list é uma coleção de documentos da web que estou analisando. Em seguida, executo o ...
Como colorir os rótulos de um dendrograma por uma variável de fator adicional em R
Eu produzi um dendrograma depois de executar a análise hierárquica de clustering em R usando o código abaixo. Agora estou tentando colorir os rótulos de acordo com outra variável de fator, que é salva como um vetor. O mais próximo que cheguei a ...
Como colorir os rótulos de um dendograma, de acordo com grupos definidos? (em R)
Eu tenho uma matriz numérica em R com 24 linhas e 10.000 colunas. Os nomes das linhas dessa matriz são basicamente nomes de arquivos dos quais li os dados correspondentes a cada uma das 24 linhas. Além disso, tenho uma lista de fatores separada ...
Como converter uma árvore em um dendrograma em R?
omo posso converter uma árvore (que é a saída do meu programa Java) em um dendrograma em Atualmente, estou convertendo a árvore para o formato Newick, usando a ...
como converter um data.frame para o objeto de estrutura de árvore, como dendrograma
Eu tenho um objeto data.frame. Por um exemplo simples:
Como colorir os galhos e os rótulos dos marcadores no heatmap.2?
Eu fiz um Mapa de Calor usando a funçãoheatmap.2 dogplots em R, mas eu não tenho uma idéia de como colorir os galhos e marcar os rótulos por grupos (por exemplo, se eu cortar a árvore para ter quatro gruops, como na minha segunda figura). ...
Transição suave entre layouts de árvore, cluster, árvore radial e cluster radial
Para um projeto, preciso alterar interativamente o layout de dados hierárquicos de uma visualização - sem nenhuma alteração nos dados subjacentes. Os layouts capazes de alternar entre si devem ser árvore, cluster, árvore radial e cluster radial. ...
Colorir ramificações do dendrograma usando uma coluna existente
Eu tenho um quadro de dados que estou tentando agrupar. estou usandohclust agora mesmo. No meu quadro de dados, há umFLAG coluna pela qual gostaria de colorir o dendrograma. Pela imagem resultante, estou tentando descobrir semelhanças ...