Resultados da pesquisa a pedido "dendrogram"
scipy.cluster.hierarchy: labels parece não estar na ordem correta e confusos com o valor dos eixos verticais
Eu sei que a hierarquia scipy.cluster. focava em lidar com a matriz de distância. Mas agora eu tenho uma matriz de similaridade ... Depois que plotei usando o Dendrogram, algo estranho acontece. Aqui está o código: similarityMatrix = ...
Colora as etiquetas de escala em um dendograma para corresponder às cores do cluster
Como posso colorir individualmente os rótulos de um dendrograma para que correspondam às cores dos clusters no MATLAB? Aqui está um exemplo de saída desejada gerada usando o código na minha resposta abaixo (observe que os rótulos são apenas as ...
Usando R para agrupar com base na distância euclidiana e em uma métrica de ligação completa, há muitos vetores?
Estou tentando descobrir como ler em uma matriz de contagens em R e, em seguida, agrupar com base na distância euclidiana e em uma métrica de ligação completa. A matriz original possui 56.000 linhas (genes) e 7 colunas (tratamentos). Quero ver se ...
R corta o dendrograma em grupos com tamanho mínimo
Existe uma maneira fácil de calcular o menor valor deh nocut que produz agrupamentos de um determinado tamanho mínimo? Neste exemplo, se eu quisesse clusters com pelo menos dez membros cada, eu deveria ir comh = 3.80: # using iris data simply ...
Como colorir os rótulos de um dendograma, de acordo com grupos definidos? (em R)
Eu tenho uma matriz numérica em R com 24 linhas e 10.000 colunas. Os nomes das linhas dessa matriz são basicamente nomes de arquivos dos quais li os dados correspondentes a cada uma das 24 linhas. Além disso, tenho uma lista de fatores separada ...
Como colorir os galhos e os rótulos dos marcadores no heatmap.2?
Eu fiz um Mapa de Calor usando a funçãoheatmap.2 dogplots em R, mas eu não tenho uma idéia de como colorir os galhos e marcar os rótulos por grupos (por exemplo, se eu cortar a árvore para ter quatro gruops, como na minha segunda figura). ...
Como colorir os rótulos de um dendrograma por uma variável de fator adicional em R
Eu produzi um dendrograma depois de executar a análise hierárquica de clustering em R usando o código abaixo. Agora estou tentando colorir os rótulos de acordo com outra variável de fator, que é salva como um vetor. O mais próximo que cheguei a ...
Colorir ramificações do dendrograma usando uma coluna existente
Eu tenho um quadro de dados que estou tentando agrupar. estou usandohclust agora mesmo. No meu quadro de dados, há umFLAG coluna pela qual gostaria de colorir o dendrograma. Pela imagem resultante, estou tentando descobrir semelhanças ...
Transição suave entre layouts de árvore, cluster, árvore radial e cluster radial
Para um projeto, preciso alterar interativamente o layout de dados hierárquicos de uma visualização - sem nenhuma alteração nos dados subjacentes. Os layouts capazes de alternar entre si devem ser árvore, cluster, árvore radial e cluster radial. ...
Rótulo e dendrograma de folhas coloridas (filogenia) em R usando pacote de macaco
Após um post anterior (Rótulo e dendrograma de folhas coloridas em r) Eu tenho uma questão de acompanhamento.Minhas perguntas são semelhantes ao post mencion...