Resultados da pesquisa a pedido "hierarchical-clustering"

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Como obter agrupamentos simples correspondentes a agrupamentos de cores no dendrograma criado por scipy

Usando o código postadoaqu [https://stackoverflow.com/questions/2455761/reordering-matrix-elements-to-reflect-column-and-row-clustering-in-naiive-python/3017704#3017704] , Criei um bom cluster hierárquico: Digamos que o dendrograma à esquerda ...

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Dendrograma de poda em scipy (agrupamento hierárquico)

Eu tenho uma matriz de distância com cerca de 5000 entradas e uso de métodos de cluster hierárquico do scipy para agrupar a matriz. O código que eu uso para ...

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como criar um mapa de calor com um cluster hierárquico externo fixo

Eu tenho um dado de matriz e quero visualizá-lo com o mapa de calor. As linhas são espécies, então eu quero visualizar a árvore filogenética de lado das linh...

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Como dar ao sns.clustermap uma matriz de distância pré-computada?

Normalmente, quando faço dendrogramas e mapas de calor, uso uma matriz de distância e faço váriasSciPy coisa. Eu quero experimentarSeaborn masSeaborn quer meus dados em formato retangular (linhas = amostras, cols = atributos, não uma matriz de ...

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Matriz de grande distância em cluster

Estou executando o R 3.2.3 em uma máquina com 16 GB de RAM. Eu tenho uma grande matriz de 3.00.000 linhas x 12 colunas. Eu quero usar um algoritmo de cluster hierárquico em R, então, antes de fazer isso, estou tentando criar uma matriz ...

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Como calcular a entropia de cluster? Um exemplo de trabalho ou código de software [fechado]

Eu gostaria de calcular a entropia deste esquema de exemplo http://nlp.stanford.edu/IR-book/html/htmledition/evaluation-of-clustering-1.html [http://nlp.stanford.edu/IR-book/html/htmledition/evaluation-of-clustering-1.html] ...

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Tutorial para scipy.cluster.hierarchy [fechado]

Estou tentando entender como manipular um cluster de hierarquia, mas a documentação é muito ... técnica? ... e não consigo entender como funciona. Existe algum tutorial que possa me ajudar, explicando passo a passo algumas tarefas ...

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Colorir ramificações do dendrograma usando uma coluna existente

Eu tenho um quadro de dados que estou tentando agrupar. estou usandohclust agora mesmo. No meu quadro de dados, há umFLAG coluna pela qual gostaria de colorir o dendrograma. Pela imagem resultante, estou tentando descobrir semelhanças ...

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Heurísticas hierárquicas de clusterização

Eu quero explorar as relações entre itens de dados em uma grande variedade. Cada item de dados representado pelo vetor multidimensional. Primeiro de tudo, eu decidi usar clusterização. Estou interessado em encontrar relações hierárquicas entre ...

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Plote o membro do cluster em r

Eu uso o pacote DTW na R. e finalmente terminei o cluster hierárquico. mas eu quero traçar agrupamentos de séries temporais separadamente como na figura abaixo. sc <- read.table("D:/handling data/confirm.csv", header=T, sep="," ) rownames(sc) ...