Resultados da pesquisa a pedido "phylogeny"

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Como plotar gráficos de pizza no haploNet Haplotype Networks {pegas}

Estou tentando usar a função haploNet de {pegas} para plotar uma rede de haplótipos, mas estou tendo problemas para colocar haplótipos iguais de diferentes populações em um mesmo gráfico. Eu posso construir uma rede de haplótipos com o seguinte ...

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Aplique a função ifelse nas dicas de cores do ventilador filogenético

Em um fã filogenético, eu gostaria de codificar por cores as dicas (semelhantes a 62 espécies neste exemplo) aplicando uma declaração if. Atualmente, estou usando o código a seguir, na tentativa de colorir todas as espécies associadas ao "O" ...

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Toda Regressão possível em R: Salvando coeficientes em uma matriz

Estou executando código para todos os modelos possíveis de um modelo linear generalizado filogenético. O problema que estou tendo é extrair e salvar os coefi...

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Rótulo e dendrograma de folhas coloridas (filogenia) em R usando pacote de macaco

Após um post anterior (Rótulo e dendrograma de folhas coloridas em r) Eu tenho uma questão de acompanhamento.Minhas perguntas são semelhantes ao post mencion...

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Etiquetas de nós na árvore filogenética circular

Estou tentando criar uma árvore filogenética circular. Eu tenho essa parte do código: fit<- hclust(dist(Data[,-4]), method = "complete", members = NULL) nclus= 3 color=c('red','blue','green') ...

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Alterar folhas de dendrograma

Eu quero modificar as propriedades das folhas em um dendrograma produzido a partir da plotagem de um objeto hclust. No mínimo, quero mudar as cores, mas qualquer ajuda que você puder fornecer será apreciada. Tentei pesquisar a resposta no ...