Resultados da pesquisa a pedido "biopython"
Como mesclar seqüências sobrepostas em python?
Eu tenho algumas cordas, ['SGALWDV', 'GALWDVP', 'ALWDVPS', 'LWDVPSP', 'WDVPSPV']Essas seqüências se sobrepõem parcialmente. Se você os sobrepusesse manualmente, obteria: SGALWDVPSPVEu quero uma maneira de ir da lista de seqüências de ...
Como chamar o módulo escrito com argparse no notebook iPython
Estou tentando passar sequências de BioPython paraImplementação de Ilya Stepanov do algoritmo de árvore de sufixos de Ukkonen [https://gist.github.com/istepanov/6506508#file-lcs-py]no ambiente de notebook do iPython. Estou tropeçando no ...
Instalação do biopython - python 3.3 não encontrado no registro
Eu estou tentando instalar o biopython para rodar com o Python 3.3 em um computador Windows7.Eu fiz o download do executável biopython biopython-1.61.win32-p...
etornar função externa [fechada]
Hii Estou recebendo o seguinte erro no Biopython: 'return' outside function (filename .. line 26) Abaixo está o código do myfile POR FAVOR AJUDE # File Name RandonProteinSequences.py # standard library import os import random # biopython from ...
xiste uma função que pode calcular uma pontuação para seqüências alinhadas, considerando os parâmetros de alinhament
Tento pontuar as seqüências já alinhadas. Deixe dize seq1 = 'PAVKDLGAEG-ASDKGT--SHVVY----------TI-QLASTFE' seq2 = 'PAVEDLGATG-ANDKGT--LYNIYARNTEGHPRSTV-QLGSTFE' com os parâmetros fornecidos substitution matrix : blosum62 gap open penalty : -5 ...