Estou tentando executar um arquivo snakemake de uma regra simples da seguinte maneira:

resources_dir='resources'

rule downloadReference:
    output:
        fa = resources_dir+'/human_g1k_v37.fasta',
        fai = resources_dir+'/human_g1k_v37.fasta.fai',
    shell:
        ('mkdir -p '+resources_dir+'; cd '+resources_dir+'; ' +
        'wget ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/1000genomes/ftp/technical/reference/human_g1k_v37.fasta.gz; gunzip human_g1k_v37.fasta.gz; ' +
        'wget ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/1000genomes/ftp/technical/reference/human_g1k_v37.fasta.fai;')

Mas eu recebo um erro como:

    Error in job downloadReference while creating output files 
    resources/human_g1k_v37.fasta, resources/human_g1k_v37.fasta.fai.
    RuleException:
    CalledProcessError in line 10 of 
    /lustre4/home/masih/projects/NGS_pipeline/snake_test:
    Command 'mkdir -p resources; cd resources; wget ftp://ftp-
  trace.ncbi.nih.gov/1000genomes/ftp/technical/reference/human_g1k_v37.fasta.gz; gunzip human_g1k_v37.fasta.gz; wget ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/1000genomes/ftp/technical/reference/human_g1k_v37.fasta.fai;' returned non-zero exit status 2.
      File "/lustre4/home/masih/projects/NGS_pipeline/snake_test", line 10, in __rule_downloadReference
      File "/home/masih/miniconda3/lib/python3.6/concurrent/futures/thread.py", line 55, in run
    Removing output files of failed job downloadReference since they might be corrupted:
    resources/human_g1k_v37.fasta
    Will exit after finishing currently running jobs.
    Exiting because a job execution failed. Look above for error message

Não estou usando a opção de threads no snakemake. Não consigo descobrir como isso está relacionado com o thread.py. Alguém tem experiência com este erro?