Eu tenho várias tabelas bastante grandes que eu criei manualmente. Eu os estava usando em um documento Rmd. Como preciso de mais controle com o LaTeX e tudo, estou usando um documento Rnw. Como posso colocar minha tabela de remarcação no arquivo Sweave?

Abaixo um exemplo mínimo (não está funcionando):

\documentclass{article}

\begin{document}
\SweaveOpts{concordance=TRUE}

% my markdown table

col1 | col2 | col3
------|:---:|:---:
row1 | cell1 | cell2 
row2 | cell3 | cell4 
row3 | cell5 | cell6 


\end{document}

Eu tentei converter a tabela dentro do documento, apenas para colar a tabela no markdown no documento Sweave e obtê-la no LaTeX. Minha tentativa gera erros, mas estou mais perto:

\documentclass{article}

\begin{document}
\SweaveOpts{concordance=TRUE}

<<texifytable, echo=FALSE, results=tex>>=
mytab = sprintf("col1 | col2 | col3
------|:---:|:---:
row1 | cell1 | cell2 
row2 | cell3 | cell4 
row3 | cell5 | cell6")
system2("pandoc", args = c("-f markdown","-t latex"),
        stdout = TRUE, input = mytab)
@

\end{document}