Vou assumir que isso é algum tipo de problema de compatibilidade. Tudo funciona perfeitamente no chrome, mas no firefox o<canvas> simplesmente não desenha nada.

function drawStage(stageNum) {
    var cap = canvasArray.length; //keeps the canvasElements
    var i;
    var stageImages = images["stage" + stageNum];
    var stageDimensions = imageDimensions["stage" + stageNum];
    //console.log("Cap is: " + cap);


    for (i = 0; i < cap; i++) {
        var canvas = document.getElementById(canvasArray[i]);
        var canvasContext = canvas.getContext("2d");
        var image = document.getElementById(stageImages[i]);

        canvasContext.clearRect(0, 0, 1280, 1280);
        canvasContext.drawImage(image, stageDimensions[i][0], stageDimensions[i][1], stageDimensions[i][2], stageDimensions[i][3]);
        //document.getElementById(zIndexes[i][0]).style["z-index"] = zIndexes[i][stageNum];
        //console.log(document.getElementById(zIndexes[i][0]).id);
    }
}

EDITAR: aqui é o link do dropbox para o exemplo de código "teste" que eu criei, muito mais simples, 1 imagem, 1 tela, 1 div, script semelhante (praticamente o mesmo), que ainda não está funcionando no firefox, mas funciona no chrome. Se você puder resolver o problema lá, isso também será resolvido.

ATUALIZAR: As matrizes estão abaixo, por solicitação, são simples entradas de diferentes elementos / coordenadas. Garanto-lhe, porém, que não há problema nas próprias matrizes, tudo funciona bem no chrome. Algo sobre o método DrawImage () da função está causando o problema que eu diria. (mais explicações abaixo das matrizes)

images é uma matriz (global) de IDs para o<img> elementos.

    var images = {
    stage1: ["character1Base", "character2Base", "character3Base", "character4Base", "character5Base", "character6Base", "character3BotImg"],
    stage2: ["character1Sit", "character2Base", "character3Base", "character4Base", "character5Base", "character6Base", "character3BotImg"],
    stage3: ["character1Sit", "character2Drink", "character3Base", "character4Base", "character5Base", "character6Base", "character3BotImg"],
    stage4: ["character1Sit", "character2Drink", "character3Base", "character4Base", "character5Base", "character6Doll", "character3BotImg"],
    stage5: ["character1Sit", "character2Drink", "character3Eat", "character4Base", "character5Base", "character6Doll", "character3EatBot"],
    stage6: ["character1Sit", "character2Stand", "character3Eat", "character4Base", "character5Base", "character6Doll", "character3EatBot"],
    stage7: ["character1Sit", "character2Stand", "character3Eat", "character4Sit", "character5Base", "character6Doll", "character3EatBot"],
    stage8: ["character1Sit", "character2Stand", "character3Eat", "character4Sit", "character5Sit", "character6Doll", "character3EatBot"],
    stage9: ["character1Sit", "character2Eat", "character3Eat", "character4Sit", "character5Sit", "character6Doll", "character3EatBot"],
    stage10: ["character1Drink", "character2Eat", "character3Eat", "character4Sit", "character5Sit", "character6Doll", "character3EatBot"]
};

imageDimensions é uma matriz (global) de poço, dimensões, posX, posY, sizeX e sizeY.

    var imageDimensions = {
    stage1: [[0, 0, 233, 485], [0, 0, 153, 407], [20, 0, 220, 200], [0, 150, 505, 210], [0, 0, 315, 391], [0, 0, 480, 435], [1, 0, 220, 180]],
    stage2: [[105, 35, 180, 440], [0, 0, 153, 407], [20, 0, 220, 200], [0, 150, 505, 210], [0, 0, 315, 391], [0, 0, 480, 435], [1, 0, 220, 180]],
    stage3: [[105, 35, 180, 440], [0, 0, 153, 407], [20, 0, 220, 200], [0, 150, 505, 210], [0, 0, 315, 391], [0, 0, 480, 435], [1, 0, 220, 180]],
    stage4: [[105, 35, 180, 440], [0, 0, 153, 407], [20, 0, 220, 200], [0, 150, 505, 210], [0, 0, 315, 391], [0, 0, 480, 435], [1, 0, 220, 180]],
    stage5: [[105, 35, 180, 440], [0, 0, 153, 407], [3, 7, 226, 180], [0, 150, 505, 210], [0, 0, 315, 391], [0, 0, 480, 435], [1, 9, 220, 180]],
    stage6: [[105, 35, 180, 440], [0, 0, 172, 490], [3, 7, 226, 180], [0, 150, 505, 210], [0, 0, 315, 391], [0, 0, 480, 435], [1, 9, 220, 180]],
    stage7: [[105, 35, 180, 440], [0, 0, 172, 490], [3, 7, 226, 180], [70, 0, 341, 380], [0, 0, 315, 391], [0, 0, 480, 435], [1, 9, 220, 180]],
    stage8: [[105, 35, 180, 440], [0, 0, 172, 490], [3, 7, 226, 180], [70, 0, 341, 380], [18, 72, 305, 422], [0, 0, 480, 435], [1, 9, 220, 180]],
    stage9: [[105, 35, 180, 440], [0, 0, 173, 473], [3, 7, 226, 180], [70, 0, 341, 380], [18, 72, 305, 422], [0, 0, 480, 435], [1, 9, 220, 180]],
    stage10: [[105, 32, 162, 440], [0, 0, 173, 473], [3, 7, 226, 180], [70, 0, 341, 380], [18, 72, 305, 422], [0, 0, 480, 435], [1, 9, 220, 180]]
};

Explicação: A função destina-se a desenhar na tela em diferentes elementos, caracteres que pertencem a esses elementos. Eles são desenhados em tela (mais tarde serão animados também em tela). ostageNum qual é o único parâmetro que a função usa determina o que será desenhado.

Alguém sabe qual é o problema? (Eu li alguns posts semelhantes, mas o problema em todos eles era layerX, layerY da posição do mouse, no entanto, não estou usando mouseover / mousein / mouseout aqui, ainda assim os elementos não são desenhados.