Eu estou tentando transpor uma tabela (10k linhas X 10K cols) usando o seguinte script.

Um exemplo simples de dados

$ cat rm1

        t1      t2      t3
n1      1       2       3
n2      2       3       44
n3      1       1       1

$ sh transpose.sh rm1

        n1      n2      n3
t1      1       2       1
t2      2       3       1
t3      3       44      1

No entanto, estou recebendo erro de memória. Qualquer ajuda seria apreciada.

awk -F "\t" '{
for (f = 1; f <= NF; f++)
a[NR, f] = $f
}
NF > nf { nf = NF }
END {
for (f = 1; f <= nf; f++)
for (r = 1; r <= NR; r++)
printf a[r, f] (r==NR ? RS : FS)
}'

Erro

awk: cmd. line:2: (FILENAME=input FNR=12658) fatal: dupnode: r->stptr: can't allocate 10 bytes of memory (Cannot allocate memory)