Eu tenho uma grade 3D com coordenadas

x = linspace(0, Lx, Nx)
y = linspace(0, Ly, Ny)
z = linspace(0, Lz, Nz)

e eu preciso indexar pontos (ou seja, x [i], y [j], z [k]) dentro de algum raio R de uma posição (x0, y0, z0). N_i pode ser bem grande. Eu posso fazer um loop simples para encontrar o que eu preciso

points=[]
i0,j0,k0 = floor( (x0,y0,z0)/grid_spacing )
Nr = (i0,j0,k0)/grid_spacing + 2
for i in range(i0-Nr, i0+Nr):
    for j in range(j0-Nr, j0+Nr):
        for k in range(k0-Nr, k0+Nr):
            if norm(array([i,j,k])*grid_spacing - (x0,y0,k0)) < cutoff:
                points.append((i,j,k))

mas isso muito lento. Existe uma maneira mais natural / rápida de fazer esse tipo de operação com numpy?