Dlaczego git wielokrotnie dodaje i usuwa sekcję Storyboard <classes>?

Podczas zapisywania serii ujęć i wprowadzania zmian do git, szanse są dobre, że całość<classes> sekcja zostanie usunięta lub dodana do kontroli źródła (git). Używam git w linii poleceń, a nie zintegrowanego interfejsu XCode.

Najpierw wygląda tak:

+    <classes>
+        <class className="CPTGraphHostingView" superclassName="UIView">
+            <source key="sourceIdentifier" type="project" relativePath="./Classes/CPTGraphHostingView.h"/>
+        </class>
...
+    </classes>

W następnym zatwierdzeniu wygląda to tak:

-    <classes>
-        <class className="CPTGraphHostingView" superclassName="UIView">
-            <source key="sourceIdentifier" type="project" relativePath="./Classes/CPTGraphHostingView.h"/>
-        </class>
...
-    </classes>

Dlaczego tak jest, a co ważniejsze: jak mogę to powstrzymać?