Resultados de la búsqueda a petición "h5py"

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Cómo sobrescribir la matriz dentro del archivo h5 usando h5py

Estoy tratando de sobrescribir una matriz numpy que es una pequeña parte de un archivo h5 bastante complicado. Estoy extrayendo una matriz, cambiando algunos valores, luego quiero volver a insertar la matriz en el archivo h5. No tengo problemas ...

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Almacenamiento de matriz de longitud variable multidimensional con h5py

Estoy tratando de almacenar una lista de matrices de longitud variable en un archivo HDF con el siguiente procedimiento: phn_mfccs = [] # Import wav files for waveform in files: phn_mfcc = mfcc(waveform) # produces a variable length multidim ...

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¿Cómo copiar parcialmente usando Python un archivo Hdf5 en uno nuevo manteniendo la misma estructura?

Tengo un gran archivo hdf5 que se parece a esto: A/B/dataset1, dataset2 A/C/dataset1, dataset2 A/D/dataset1, dataset2 A/E/dataset1, dataset2... Quiero crear un nuevo archivo solo con eso: A / B / dataset1, dataset2 A / C / dataset1, ...

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escrituras incrementales en hdf5 con h5py

Tengo una pregunta sobre cómo escribir mejor en archivos hdf5 con python / h5py. Tengo datos como: ----------------------------------------- | timepoint | voltage1 | voltage2 | ... ----------------------------------------- | 178 | 10 | 12 | ...

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IOError: No se pueden leer los datos (No se puede abrir el directorio) - Falta el filtro de compresión gzip

Nunca antes había trabajado con archivos HDF5 y, para comenzar, recibí algunos archivos de ejemplo. He estado revisando todos los conceptos básicos conh5py, mirando los diferentes grupos en estos archivos, sus nombres, claves, valores, etc. Todo ...

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lea el archivo matlab v7.3 en la lista de python de matrices numpy a través de h5py

Sé que esto se ha preguntado antes, pero en mi opinión todavía no hay respuestas que expliquen qué está sucediendo y que no funcionan para mi caso. Tengo un archivo matlab v7. 3 que está estructurado así, ---> rank <1x454 cell> ---> each element ...

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¿Experiencia con el uso de h5py para hacer trabajo analítico en big data en Python?

Hago mucho trabajo estadístico y uso Python como mi idioma principal. Sin embargo, algunos de los conjuntos de datos con los que trabajo pueden ocupar 20 GB de memoria, lo que hace que sea casi imposible operarlos utilizando funciones en memoria ...

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Lectura de TODAS las variables en un archivo .mat con python h5py

Estoy tratando de extraer todas las variables de un archivo '.mat' v7.3 y convertirlas en matrices NumPy. ¿Hay alguna manera de hacer esto genéricamente, preferiblemente sin necesidad de especificar nombres de variables? ¿Cómo puede obtener todos ...

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Cerrar un archivo de datos h5py abierto

En nuestro laboratorio almacenamos nuestros datos enhdf5 archivos a través del paquete pythonh5py. Al comienzo de un experimento creamos unhdf5 archivar y almacenar matriz tras matriz de matriz de datos en el archivo (entre otras cosas). Cuando ...

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¿Cómo atravesar un archivo hdf5 usando h5py

¿Cómo recorro todos los grupos y conjuntos de datos de un archivo hdf5 usando h5py? Quiero recuperar todo el contenido del archivo desde una raíz común usando un bucle for o algo similar.