Resultados de la búsqueda a petición "hdf5"

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PCA incremental en big data

Acabo de intentar usar el IncrementalPCA de sklearn.decomposition, pero arrojó un MemoryError al igual que el PCA y RandomizedPCA antes. Mi problema es que la matriz que estoy tratando de cargar es demasiado grande para caber en la RAM. En este ...

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¿Pasar el archivo hdf5 a h5py como binario blob / cadena?

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¿Alguien tiene experiencia en abrir archivos hdf en R (sistema operativo Windows)?

No puedo trabajar con archivos hdf en R. Creo que el paquete R

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Guardar en un archivo una matriz o DataFrame junto con otra información

El software estadísticoStata [https://www.stata.com/]permite guardar fragmentos de texto cortos dentro de un conjunto de datos. Esto se logra usandonotes [https://www.stata.com/manuals13/dnotes.pdf]y / ...

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¿Cómo importar un archivo gzip mayor que el límite de RAM en un Pandas DataFrame? "Kill 9" ¿Usa HDF5?

tengo ungzip que es de aproximadamente 90 GB. Esto está bien dentro del espacio en disco, pero mucho más grande que la RAM. ¿Cómo puedo importar esto a un marco de datos de pandas? Intenté lo siguiente en la línea de comando: # start with ...

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ImportError HDFStore requiere PyTables No hay módulos con nombre en tablas

import pandas as pd dfs = pd.HDFStore('xxxxx.h5')arroja este error: "ImportError: HDFStore requires PyTables, "No module named tables" problem importing" Intenté instalar PyTables, que requiere Cython. Tengo instalado Cython 0.21, pero arroja ...

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escrituras incrementales en hdf5 con h5py

Tengo una pregunta sobre cómo escribir mejor en archivos hdf5 con python / h5py. Tengo datos como: ----------------------------------------- | timepoint | voltage1 | voltage2 | ... ----------------------------------------- | 178 | 10 | 12 | ...

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Almacenamiento de matriz de longitud variable multidimensional con h5py

Estoy tratando de almacenar una lista de matrices de longitud variable en un archivo HDF con el siguiente procedimiento: phn_mfccs = [] # Import wav files for waveform in files: phn_mfcc = mfcc(waveform) # produces a variable length multidim ...

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Ahorro con matrices h5py de diferentes tamaños

Estoy tratando de almacenar alrededor de 3000 matrices numpy usando el formato de datos HDF5. Las matrices varían en longitud de 5306 a 121999 np.float64 estoy obteniendoObject dtype dtype('O') has no native HDF5 equivalent error ya que debido a ...

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Instalar h5py en OS X

He pasado el día tratando de obtener elh5py módulo de python funcionando, pero sin éxito. Instalé bibliotecas compartidas HDF5, seguí las instrucciones que pude encontrar en la web para hacerlo bien. Pero no funciona, a continuación se muestra ...