Resultados de la búsqueda a petición "hdf5"

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Leyendo una cadena de hdf5 en C ++

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escrituras incrementales en hdf5 con h5py

Tengo una pregunta sobre cómo escribir mejor en archivos hdf5 con python / h5py. Tengo datos como: ----------------------------------------- | timepoint | voltage1 | voltage2 | ... ----------------------------------------- | 178 | 10 | 12 | ...

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Conjunto de datos HDF5 creado por Python transpuesto en Matlab

Tengo algunos datos que comparto entre Python y Matlab. Solía hacerlo guardando matrices NumPy en archivos .mat de estilo MATLAB, pero me gustaría cambiar a conjuntos de datos HDF5. Sin embargo, noté una característica divertida: cuando guardo ...

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Error de construcción de C ++ para un código simple usando las bibliotecas armadillo y hdf5

Soy bastante nuevo en C ++ y armadillo, y me quedo atascado con un error de construcción que se describe a continuación. Estoy tratando de probar el siguiente código simple para guardar una matriz de armadillo como archivo hdf5: #include ...

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¿Cómo importar un archivo gzip mayor que el límite de RAM en un Pandas DataFrame? "Kill 9" ¿Usa HDF5?

tengo ungzip que es de aproximadamente 90 GB. Esto está bien dentro del espacio en disco, pero mucho más grande que la RAM. ¿Cómo puedo importar esto a un marco de datos de pandas? Intenté lo siguiente en la línea de comando: # start with ...

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¿Puedo leer el archivo h5 en una máquina como bytearray, transmitir ese bytearray a otra máquina y luego cargarlo desde bytearray en otra máquina?

Tengo el siguiente requisito: tengo un archivo h5 en una máquina (fuente), que quiero usar en otra máquina (de destino). Actualmente siento que debería leer ese archivo h5 como bytearray en la máquina de origen, transmitir el bytearray a la ...

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PCA incremental en big data

Acabo de intentar usar el IncrementalPCA de sklearn.decomposition, pero arrojó un MemoryError al igual que el PCA y RandomizedPCA antes. Mi problema es que la matriz que estoy tratando de cargar es demasiado grande para caber en la RAM. En este ...

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HDFStore.append (cadena, marco de datos) falla cuando el contenido de la columna de cadena es más largo que los que ya están allí

Tengo un Pandas DataFrame almacenado a través de un HDFStore que esencialmente almacena filas de resumen sobre las pruebas que estoy realizando.Varios de los...

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Almacenamiento de matriz de longitud variable multidimensional con h5py

Estoy tratando de almacenar una lista de matrices de longitud variable en un archivo HDF con el siguiente procedimiento: phn_mfccs = [] # Import wav files for waveform in files: phn_mfcc = mfcc(waveform) # produces a variable length multidim ...

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Almacenando objetos Pandas junto con objetos Python regulares en HDF5

Pandas tiene uninterfaz agradable que facilita el almacenamiento de cosas como Dataframes y Series en un HDF5: