Resultados da pesquisa a pedido "h5py"
Como sobrescrever matriz dentro do arquivo h5 usando o h5py
Estou tentando sobrescrever uma matriz numpy que é uma pequena parte de um arquivo h5 bastante complicado. Estou extraindo uma matriz, alterando alguns valores e, em seguida, quero reinserir a matriz no arquivo h5. Não tenho problema em extrair ...
Como copiar parcialmente usando python um arquivo Hdf5 em um novo mantendo a mesma estrutura?
Eu tenho um arquivo hdf5 grande que se parece com isso: A/B/dataset1, dataset2 A/C/dataset1, dataset2 A/D/dataset1, dataset2 A/E/dataset1, dataset2... Quero criar um novo arquivo apenas com isso: A / B / conjunto de dados1, conjunto de dados2 A ...
gravações incrementais em hdf5 com h5py
Eu tenho uma pergunta sobre a melhor forma de gravar em arquivos hdf5 com python / h5py. Eu tenho dados como: ----------------------------------------- | timepoint | voltage1 | voltage2 | ... ----------------------------------------- | 178 | 10 ...
IOError: Não é possível ler dados (Não é possível abrir o diretório) - Filtro de compactação gzip ausente
Eu nunca trabalhei com arquivos HDF5 antes e, para começar, recebi alguns arquivos de exemplo. Estive verificando todos os conceitos básicos comh5py, observando os diferentes grupos nesses arquivos, seus nomes, chaves, valores e assim por diante. ...
O arquivo HDF5 criado com o h5py não pode ser aberto pelo h5py
Criei um arquivo HDF5 aparentemente sem problemas, no Ubuntu 12.04 (versão 32 bits), usando o Anaconda como distribuição Python e escrevendo em notebooks ipython. Os dados subjacentes são todos matrizes numpy. Por exemplo, import numpy as np ...
Existe uma vantagem de velocidade de análise ou uso de memória no uso do HDF5 para armazenamento em grandes matrizes (em vez de arquivos binários simples)?
Estou processando grandes matrizes 3D, que muitas vezes preciso dividir de várias maneiras para fazer uma variedade de análises de dados. Um "cubo" típico pode ter ~ 100 GB (e provavelmente aumentará no futuro) Parece que o formato de arquivo ...
leia o arquivo matlab v7.3 na lista python de matrizes numpy via h5py
Sei que isso já foi perguntado antes, mas, na minha opinião, ainda não há respostas que expliquem o que está acontecendo e que não funcionam no meu caso. Eu tenho um arquivo matlab v7., 3 que está estruturado assim, ---> rank <1x454 cell> ---> ...
Lendo a matriz de células de um Matlab salva como um arquivo v7.3 .mat com o H5py
Salvei uma matriz de células como um arquivo .mat no Matlab da seguinte maneira: test = {'hello'; 'world!'}; save('data.mat', 'test', '-v7.3')Como posso importá-lo como a lista de strings no Python com o H5py? eu tentei f = ...
Lendo TODAS as variáveis em um arquivo .mat com python h5py
Estou tentando extrair todas as variáveis de um arquivo '.mat' v7.3 e transformá-las em matrizes NumPy. Existe uma maneira de fazer isso genericamente, preferencialmente não precisando especificar nomes de variáveis? Como você pode obter todos os ...
Feche um arquivo de dados h5py aberto
Em nosso laboratório, armazenamos nossos dados emhdf5 arquivos através do pacote pythonh5py. No início de um experimento, criamos umhdf5 arquivar e armazenar matriz após matriz de matriz de dados no arquivo (entre outras coisas). Quando ...