Suchergebnisse für Anfrage "h5py"
Ist die Verwendung von HDF5 für die Speicherung großer Arrays (anstelle von flachen Binärdateien) von Vorteil für die Analysegeschwindigkeit oder die Speichernutzung?
Ich verarbeite große 3D-Arrays, die ich häufig auf verschiedene Arten schneiden muss, um eine Vielzahl von Datenanalysen durchzuführen. Ein typischer "Würfel" kann ~ 100 GB groß sein (und wird wahrscheinlich in Zukunft größer werden) Es ...
matlab v7.3-Datei über h5py @ in die Python-Liste der Numpy-Arrays einles
Ich weiß, dass dies schon einmal gefragt wurde, aber meiner Meinung nach gibt es immer noch keine Antworten, die erklären, was los ist und nicht für meinen Fall funktionieren. Ich habe eine Matlab v7., 3-Datei, die so aufgebaut ist, ---> rank ...
Lesen eines Matlab-Zellenarrays, das mit H5py als .mat-Datei der Version 7.3 gespeichert wurde
Ich habe ein Zellenarray in Matlab wie folgt als .mat-Datei gespeichert: test = {'hello'; 'world!'}; save('data.mat', 'test', '-v7.3')Wie kann ich es mit H5py als Liste von Strings in Python importieren? Ich habe es versuch f = ...
Lesen Sie ALLE Variablen in einer .mat-Datei mit python h5py
Ich versuche, alle Variablen aus einer '.mat' v7.3-Datei zu ziehen und in NumPy-Arrays umzuwandeln. Gibt es eine Möglichkeit, dies generisch zu tun, wobei vorzugsweise keine Variablennamen angegeben werden müssen? Wie können Sie alle vorhandenen ...
Schließen Sie eine geöffnete h5py-Datendatei
n unserem Labor speichern wir unsere Daten inhdf5 Dateien durch das Python-Paketh5py. u Beginn eines Experiments erstellen wir einhdf5 file und speichere Array nach Array von Daten in der Datei (unter anderem). Wenn ein Experiment ...
Wie durchquere ich eine hdf5-Datei mit h5py
Wie kann ich mit h5py alle Gruppen und Datensätze einer hdf5-Datei durchlaufen? Ich möchte den gesamten Inhalt der Datei mit einer for-Schleife oder ähnlichem von einem gemeinsamen Stammverzeichnis abrufen.
Was ist die empfohlene Komprimierung für HDF5 für eine schnelle Lese- / Schreibleistung (in Python / Pandas)?
Ich habe mehrmals gelesen, dass das Aktivieren der Komprimierung in HDF5 zu einer besseren Lese- / Schreibleistung führen kann. Ich frage mich, welche idealen Einstellungen für eine gute Lese- / Schreibleistung geeignet ...
Korrupte Dateien beim Erstellen von HDF5-Dateien, ohne sie zu schließen (h5py)
Ich verwende h5py, um Experimentdaten in einem HDF5-Container zu speichern. In einer interaktiven Sitzung öffne ich die Datei mit: measurement_data = h5py.File('example.hdf5', 'a')Dann schreibe ich Daten mithilfe einiger selbst geschriebener ...
out of core 4D image tif speicher als hdf5 python
Ich habe 27 GB 2D-Tiff-Dateien, die Teile eines Films mit 3D-Bildern darstellen. Ich möchte in der Lage sein, diese Daten aufzuteilen, als ob es ein einfaches numpy4d-Array wäre. Es sieht so aus, als ob dask.array ein gutes Werkzeug ist, um das ...
Schreiben eines zusammengesetzten Datensatzes mit einer Zeichenfolge variabler Länge über h5py (HDF5)
Ich konnte in meiner HDF5-Datei mit h5py ein zusammengesetztes Dataset erstellen, das aus einem vorzeichenlosen int und einem String variabler Länge besteht, aber ich kann nicht darauf schreiben. dt = h5py.special_dtype(vlen=str) dset = ...