Resultados de la búsqueda a petición "h5py"
¿Cómo copiar parcialmente usando Python un archivo Hdf5 en uno nuevo manteniendo la misma estructura?
Tengo un gran archivo hdf5 que se parece a esto: A/B/dataset1, dataset2 A/C/dataset1, dataset2 A/D/dataset1, dataset2 A/E/dataset1, dataset2... Quiero crear un nuevo archivo solo con eso: A / B / dataset1, dataset2 A / C / dataset1, ...
Ahorro con matrices h5py de diferentes tamaños
Estoy tratando de almacenar alrededor de 3000 matrices numpy usando el formato de datos HDF5. Las matrices varían en longitud de 5306 a 121999 np.float64 estoy obteniendoObject dtype dtype('O') has no native HDF5 equivalent error ya que debido a ...
¿Cómo establecer la configuración de la memoria caché utilizando la interfaz de alto nivel h5py?
Estoy intentando aumentar el tamaño del caché para mis archivos HDF5, pero no parece estar funcionando. Esto es lo que tengo:
Escribir en un conjunto de datos compuesto con una cadena de longitud variable a través de h5py (HDF5)
He podido crear un conjunto de datos compuesto que consiste en un int sin signo y una cadena de longitud variable en mi archivo HDF5 usando h5py, pero no puedo escribir en él. dt = h5py.special_dtype(vlen=str) dset = fout.create_dataset(ver, ...
escrituras incrementales en hdf5 con h5py
Tengo una pregunta sobre cómo escribir mejor en archivos hdf5 con python / h5py. Tengo datos como: ----------------------------------------- | timepoint | voltage1 | voltage2 | ... ----------------------------------------- | 178 | 10 | 12 | ...
¿Experiencia con el uso de h5py para hacer trabajo analítico en big data en Python?
Hago mucho trabajo estadístico y uso Python como mi idioma principal. Sin embargo, algunos de los conjuntos de datos con los que trabajo pueden ocupar 20 GB de memoria, lo que hace que sea casi imposible operarlos utilizando funciones en memoria ...
Archivos corruptos al crear archivos HDF5 sin cerrarlos (h5py)
Estoy usando h5py para almacenar datos de experimentos en un contenedor HDF5. En una sesión interactiva abro el archivo usando: measurement_data = h5py.File('example.hdf5', 'a')Luego escribo datos en el archivo usando algunas funciones ...
¿Puedo leer el archivo h5 en una máquina como bytearray, transmitir ese bytearray a otra máquina y luego cargarlo desde bytearray en otra máquina?
Tengo el siguiente requisito: tengo un archivo h5 en una máquina (fuente), que quiero usar en otra máquina (de destino). Actualmente siento que debería leer ese archivo h5 como bytearray en la máquina de origen, transmitir el bytearray a la ...
Cómo sobrescribir la matriz dentro del archivo h5 usando h5py
Estoy tratando de sobrescribir una matriz numpy que es una pequeña parte de un archivo h5 bastante complicado. Estoy extrayendo una matriz, cambiando algunos valores, luego quiero volver a insertar la matriz en el archivo h5. No tengo problemas ...
Escribir un gran conjunto de datos hdf5 usando h5py
Por el momento, estoy usando h5py para generar conjuntos de datos hdf5. Tengo algo como esto import h5py import numpy as np my_data=np.genfromtxt("/tmp/data.csv",delimiter=",",dtype=None,names=True) myFile="/tmp/f.hdf" with h5py.File(myFile,"a") ...