Resultados da pesquisa a pedido "h5py"
gravações incrementais em hdf5 com h5py
Eu tenho uma pergunta sobre a melhor forma de gravar em arquivos hdf5 com python / h5py. Eu tenho dados como: ----------------------------------------- | timepoint | voltage1 | voltage2 | ... ----------------------------------------- | 178 | 10 ...
Experiência com o uso do h5py para realizar trabalho analítico em big data em Python?
Eu faço muito trabalho estatístico e uso o Python como minha linguagem principal. Alguns dos conjuntos de dados com os quais trabalho podem levar 20 GB de memória, o que impossibilita a operação usando funções na memória numpy, scipy e PyIMSL. A ...
h5py: maneira correta de dividir conjuntos de dados da matriz
Estou um pouco confuso aqui: Até onde eu entendi, o h5py's.value O método lê um conjunto de dados inteiro e o despeja em uma matriz, o que é lento e desanimado (e geralmente deve ser substituído por[()]. A maneira correta é usar fatias ...
Como sobrescrever matriz dentro do arquivo h5 usando o h5py
Estou tentando sobrescrever uma matriz numpy que é uma pequena parte de um arquivo h5 bastante complicado. Estou extraindo uma matriz, alterando alguns valores e, em seguida, quero reinserir a matriz no arquivo h5. Não tenho problema em extrair ...
Gravando um grande conjunto de dados hdf5 usando o h5py
No momento, estou usando o h5py para gerar conjuntos de dados hdf5. Eu tenho algo parecido com isto import h5py import numpy as np my_data=np.genfromtxt("/tmp/data.csv",delimiter=",",dtype=None,names=True) myFile="/tmp/f.hdf" with ...
h5py não adere à especificação de fragmentação?
Problema: Eu tenho arquivos netCDF4 existentes (cerca de 5000 deles), (normalmente no formato 96x3712x3712), pontos de dados (float32). São arquivos com a primeira dimensão sendo hora (1 arquivo por dia), a segunda e a terceira dimensões ...
Como anexar dados a um conjunto de dados específico em um arquivo hdf5 com o h5py
Estou procurando uma possibilidade de acrescentar dados a um conjunto de dados existente dentro de um arquivo h5 usando python (h5py). Uma breve introdução ao meu projeto: tento treinar uma CNN usando dados de imagens médicas. Devido à enorme ...
fora do núcleo da imagem 4D tif de armazenamento como hdf5 python
Eu tenho 27 GB de arquivos tiff 2D que representam fatias de um filme de imagens 3D. Eu quero ser capaz de dividir esses dados como se fosse uma matriz numpy4d simples. Parece que o dask.array é uma boa ferramenta para manipular de maneira limpa ...
Lendo TODAS as variáveis em um arquivo .mat com python h5py
Estou tentando extrair todas as variáveis de um arquivo '.mat' v7.3 e transformá-las em matrizes NumPy. Existe uma maneira de fazer isso genericamente, preferencialmente não precisando especificar nomes de variáveis? Como você pode obter todos os ...