¿Aplicación de ASP.NET anidada dentro de IIS que hereda los valores de configuración principal?

Actualmente tengo 2 aplicaciones web ASP.NET 3.5 en IIS7 (llamémoslas WebParent y WebChild).

WebChild está anidado dentro de la lista de WebParent en IIS7 y está configurado como una aplicación (en lugar de solo un directorio virtual dentro de WebParent). Ambos utilizan actualmente su propio grupo de aplicaciones (clásico).

Tanto WebParent como WebChild tienen sus propios archivos web.config completamente definidos en sus propios directorios raíz.

Supuse que, dado que WebChild se define como una 'Aplicación' dentro de IIS, no heredaría nada del archivo de configuración de WebParent. Sin embargo, a pesar de esta configuración, veo errores relacionados con varios elementos dentro de web.config que ya están definidos (lo cual es correcto, hay un par de elementos que están en ambos archivos de configuración, pero pensé que deberían tratarse de forma completamente independiente de uno) otro)?

¿Alguien puede aclarar por qué esto podría estar ocurriendo?

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